Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700066B19RikQ3TS39 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
1700066B19RikQ3TS39 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700066B19RikQ3TS39 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700066B19RikQ3TS39 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
1700066B19RikQ3TS39 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700066B19RikQ3TS39 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
1700066B19RikQ3TS39 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700066B19RikQ3TS39 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
1700066B19RikQ3TS39 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700066B19RikQ3TS39 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700066B19RikQ3TS39 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
1700066B19RikQ3TS39 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700066B19RikQ3TS39 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700066B19RikQ3TS39 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
1700066B19RikQ3TS39 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
1700066B19RikQ3TS39 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700066B19RikQ3TS39 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700066B19RikQ3TS39 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700066B19RikQ3TS39 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
1700066B19RikQ3TS39 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700066B19RikQ3TS39 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700066B19RikQ3TS39 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700066B19RikQ3TS39 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700066B19RikQ3TS39 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700066B19RikQ3TS39 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700066B19RikQ3TS39 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
1700066B19RikQ3TS39 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700066B19RikQ3TS39 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700066B19RikQ3TS39 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700066B19RikQ3TS39 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
1700066B19RikQ3TS39 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
1700066B19RikQ3TS39 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700066B19RikQ3TS39 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700066B19RikQ3TS39 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700066B19RikQ3TS39 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700066B19RikQ3TS39 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700066B19RikQ3TS39 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700066B19RikQ3TS39 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700066B19RikQ3TS39 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700066B19RikQ3TS39 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700066B19RikQ3TS39 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700066B19RikQ3TS39 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700066B19RikQ3TS39 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700066B19RikQ3TS39 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700066B19RikQ3TS39 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700066B19RikQ3TS39 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700066B19RikQ3TS39 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
1700066B19RikQ3TS39 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700066B19RikQ3TS39 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700066B19RikQ3TS39 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700066B19RikQ3TS39 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700066B19RikQ3TS39 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700066B19RikQ3TS39 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700066B19RikQ3TS39 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700066B19RikQ3TS39 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700066B19RikQ3TS39 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700066B19RikQ3TS39 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700066B19RikQ3TS39 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700066B19RikQ3TS39 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700066B19RikQ3TS39 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700066B19RikQ3TS39 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700066B19RikQ3TS39 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
1700066B19RikQ3TS39 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
1700066B19RikQ3TS39 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700066B19RikQ3TS39 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700066B19RikQ3TS39 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
1700066B19RikQ3TS39 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700066B19RikQ3TS39 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
1700066B19RikQ3TS39 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700066B19RikQ3TS39 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
1700066B19RikQ3TS39 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
1700066B19RikQ3TS39 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
1700066B19RikQ3TS39 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700066B19RikQ3TS39 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
1700066B19RikQ3TS39 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700066B19RikQ3TS39 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700066B19RikQ3TS39 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700066B19RikQ3TS39 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700066B19RikQ3TS39 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700066B19RikQ3TS39 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700066B19RikQ3TS39 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700066B19RikQ3TS39 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700066B19RikQ3TS39 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700066B19RikQ3TS39 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700066B19RikQ3TS39 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
1700066B19RikQ3TS39 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700066B19RikQ3TS39 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700066B19RikQ3TS39 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700066B19RikQ3TS39 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700066B19RikQ3TS39 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700066B19RikQ3TS39 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700066B19RikQ3TS39 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700066B19RikQ3TS39 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700066B19RikQ3TS39 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700066B19RikQ3TS39 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700066B19RikQ3TS39 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700066B19RikQ3TS39 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700066B19RikQ3TS39 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700066B19RikQ3TS39 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms