Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gtf2f1Q3THK3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gtf2f1Q3THK3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Gtf2f1Q3THK3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gtf2f1Q3THK3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gtf2f1Q3THK3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Gtf2f1Q3THK3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf2f1Q3THK3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf2f1Q3THK3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf2f1Q3THK3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf2f1Q3THK3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf2f1Q3THK3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf2f1Q3THK3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gtf2f1Q3THK3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gtf2f1Q3THK3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gtf2f1Q3THK3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gtf2f1Q3THK3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gtf2f1Q3THK3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gtf2f1Q3THK3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gtf2f1Q3THK3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gtf2f1Q3THK3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtf2f1Q3THK3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtf2f1Q3THK3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtf2f1Q3THK3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gtf2f1Q3THK3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf2f1Q3THK3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf2f1Q3THK3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf2f1Q3THK3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf2f1Q3THK3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf2f1Q3THK3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gtf2f1Q3THK3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gtf2f1Q3THK3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gtf2f1Q3THK3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gtf2f1Q3THK3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gtf2f1Q3THK3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gtf2f1Q3THK3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gtf2f1Q3THK3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gtf2f1Q3THK3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gtf2f1Q3THK3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf2f1Q3THK3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf2f1Q3THK3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf2f1Q3THK3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Gtf2f1Q3THK3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf2f1Q3THK3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf2f1Q3THK3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf2f1Q3THK3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf2f1Q3THK3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gtf2f1Q3THK3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gtf2f1Q3THK3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gtf2f1Q3THK3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gtf2f1Q3THK3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gtf2f1Q3THK3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gtf2f1Q3THK3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gtf2f1Q3THK3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Gtf2f1Q3THK3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Gtf2f1Q3THK3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gtf2f1Q3THK3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Gtf2f1Q3THK3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gtf2f1Q3THK3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf2f1Q3THK3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf2f1Q3THK3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gtf2f1Q3THK3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Gtf2f1Q3THK3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gtf2f1Q3THK3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtf2f1Q3THK3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtf2f1Q3THK3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gtf2f1Q3THK3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtf2f1Q3THK3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtf2f1Q3THK3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtf2f1Q3THK3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf2f1Q3THK3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf2f1Q3THK3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf2f1Q3THK3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf2f1Q3THK3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtf2f1Q3THK3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtf2f1Q3THK3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtf2f1Q3THK3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtf2f1Q3THK3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtf2f1Q3THK3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Gtf2f1Q3THK3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gtf2f1Q3THK3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gtf2f1Q3THK3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf2f1Q3THK3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gtf2f1Q3THK3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtf2f1Q3THK3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtf2f1Q3THK3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtf2f1Q3THK3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtf2f1Q3THK3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtf2f1Q3THK3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2f1Q3THK3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf2f1Q3THK3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtf2f1Q3THK3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtf2f1Q3THK3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf2f1Q3THK3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf2f1Q3THK3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf2f1Q3THK3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gtf2f1Q3THK3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms