Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc69Q3TCJ8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc69Q3TCJ8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc69Q3TCJ8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc69Q3TCJ8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc69Q3TCJ8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc69Q3TCJ8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc69Q3TCJ8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc69Q3TCJ8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc69Q3TCJ8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc69Q3TCJ8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc69Q3TCJ8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc69Q3TCJ8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc69Q3TCJ8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc69Q3TCJ8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc69Q3TCJ8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc69Q3TCJ8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc69Q3TCJ8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc69Q3TCJ8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc69Q3TCJ8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc69Q3TCJ8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc69Q3TCJ8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc69Q3TCJ8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc69Q3TCJ8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc69Q3TCJ8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc69Q3TCJ8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc69Q3TCJ8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc69Q3TCJ8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc69Q3TCJ8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc69Q3TCJ8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc69Q3TCJ8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc69Q3TCJ8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc69Q3TCJ8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc69Q3TCJ8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc69Q3TCJ8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms