Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cul4aQ3TCH7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cul4aQ3TCH7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cul4aQ3TCH7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cul4aQ3TCH7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cul4aQ3TCH7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cul4aQ3TCH7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cul4aQ3TCH7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cul4aQ3TCH7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cul4aQ3TCH7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cul4aQ3TCH7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cul4aQ3TCH7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cul4aQ3TCH7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cul4aQ3TCH7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cul4aQ3TCH7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cul4aQ3TCH7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cul4aQ3TCH7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cul4aQ3TCH7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cul4aQ3TCH7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cul4aQ3TCH7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cul4aQ3TCH7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cul4aQ3TCH7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cul4aQ3TCH7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cul4aQ3TCH7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cul4aQ3TCH7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cul4aQ3TCH7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cul4aQ3TCH7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cul4aQ3TCH7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cul4aQ3TCH7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cul4aQ3TCH7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cul4aQ3TCH7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cul4aQ3TCH7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cul4aQ3TCH7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cul4aQ3TCH7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cul4aQ3TCH7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cul4aQ3TCH7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cul4aQ3TCH7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cul4aQ3TCH7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cul4aQ3TCH7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cul4aQ3TCH7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cul4aQ3TCH7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cul4aQ3TCH7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cul4aQ3TCH7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cul4aQ3TCH7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cul4aQ3TCH7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cul4aQ3TCH7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cul4aQ3TCH7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cul4aQ3TCH7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul4aQ3TCH7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul4aQ3TCH7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul4aQ3TCH7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul4aQ3TCH7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cul4aQ3TCH7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul4aQ3TCH7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul4aQ3TCH7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cul4aQ3TCH7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cul4aQ3TCH7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul4aQ3TCH7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul4aQ3TCH7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul4aQ3TCH7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul4aQ3TCH7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul4aQ3TCH7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cul4aQ3TCH7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cul4aQ3TCH7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cul4aQ3TCH7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul4aQ3TCH7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul4aQ3TCH7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul4aQ3TCH7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cul4aQ3TCH7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cul4aQ3TCH7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul4aQ3TCH7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul4aQ3TCH7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cul4aQ3TCH7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cul4aQ3TCH7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul4aQ3TCH7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cul4aQ3TCH7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cul4aQ3TCH7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul4aQ3TCH7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cul4aQ3TCH7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cul4aQ3TCH7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cul4aQ3TCH7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul4aQ3TCH7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul4aQ3TCH7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cul4aQ3TCH7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul4aQ3TCH7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul4aQ3TCH7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cul4aQ3TCH7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cul4aQ3TCH7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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