Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Treml4Q3LRV9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Treml4Q3LRV9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Treml4Q3LRV9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Treml4Q3LRV9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Treml4Q3LRV9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Treml4Q3LRV9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Treml4Q3LRV9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Treml4Q3LRV9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Treml4Q3LRV9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Treml4Q3LRV9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Treml4Q3LRV9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Treml4Q3LRV9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Treml4Q3LRV9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Treml4Q3LRV9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Treml4Q3LRV9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Treml4Q3LRV9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Treml4Q3LRV9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Treml4Q3LRV9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Treml4Q3LRV9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Treml4Q3LRV9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Treml4Q3LRV9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Treml4Q3LRV9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Treml4Q3LRV9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Treml4Q3LRV9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Treml4Q3LRV9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Treml4Q3LRV9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Treml4Q3LRV9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Treml4Q3LRV9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Treml4Q3LRV9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Treml4Q3LRV9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Treml4Q3LRV9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Treml4Q3LRV9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Treml4Q3LRV9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Treml4Q3LRV9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Treml4Q3LRV9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Treml4Q3LRV9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Treml4Q3LRV9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Treml4Q3LRV9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Treml4Q3LRV9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Treml4Q3LRV9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Treml4Q3LRV9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Treml4Q3LRV9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Treml4Q3LRV9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Treml4Q3LRV9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Treml4Q3LRV9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Treml4Q3LRV9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Treml4Q3LRV9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Treml4Q3LRV9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Treml4Q3LRV9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Treml4Q3LRV9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Treml4Q3LRV9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Treml4Q3LRV9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Treml4Q3LRV9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Treml4Q3LRV9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Treml4Q3LRV9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Treml4Q3LRV9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Treml4Q3LRV9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Treml4Q3LRV9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms