Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Tdrd9Q14BI7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Tdrd9Q14BI7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Tdrd9Q14BI7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Tdrd9Q14BI7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Tdrd9Q14BI7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Tdrd9Q14BI7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Tdrd9Q14BI7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
Tdrd9Q14BI7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Tdrd9Q14BI7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Tdrd9Q14BI7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Tdrd9Q14BI7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Tdrd9Q14BI7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Tdrd9Q14BI7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Tdrd9Q14BI7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Tdrd9Q14BI7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Tdrd9Q14BI7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Tdrd9Q14BI7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Tdrd9Q14BI7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Tdrd9Q14BI7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Tdrd9Q14BI7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Tdrd9Q14BI7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Tdrd9Q14BI7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Tdrd9Q14BI7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Tdrd9Q14BI7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Tdrd9Q14BI7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Tdrd9Q14BI7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Tdrd9Q14BI7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Tdrd9Q14BI7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Tdrd9Q14BI7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Tdrd9Q14BI7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Tdrd9Q14BI7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Tdrd9Q14BI7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Tdrd9Q14BI7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
Tdrd9Q14BI7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Tdrd9Q14BI7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
Tdrd9Q14BI7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Tdrd9Q14BI7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Tdrd9Q14BI7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Tdrd9Q14BI7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Tdrd9Q14BI7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Tdrd9Q14BI7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Tdrd9Q14BI7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Tdrd9Q14BI7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Tdrd9Q14BI7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Tdrd9Q14BI7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Tdrd9Q14BI7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Tdrd9Q14BI7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Tdrd9Q14BI7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Tdrd9Q14BI7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Tdrd9Q14BI7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Tdrd9Q14BI7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Tdrd9Q14BI7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Tdrd9Q14BI7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Tdrd9Q14BI7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Tdrd9Q14BI7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Tdrd9Q14BI7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Tdrd9Q14BI7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
Tdrd9Q14BI7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Tdrd9Q14BI7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Tdrd9Q14BI7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Tdrd9Q14BI7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Tdrd9Q14BI7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Tdrd9Q14BI7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Tdrd9Q14BI7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Tdrd9Q14BI7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Tdrd9Q14BI7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Tdrd9Q14BI7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Tdrd9Q14BI7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Tdrd9Q14BI7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Tdrd9Q14BI7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Tdrd9Q14BI7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Tdrd9Q14BI7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Tdrd9Q14BI7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Tdrd9Q14BI7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Tdrd9Q14BI7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Tdrd9Q14BI7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Tdrd9Q14BI7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Tdrd9Q14BI7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Tdrd9Q14BI7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Tdrd9Q14BI7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Tdrd9Q14BI7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Tdrd9Q14BI7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Tdrd9Q14BI7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Tdrd9Q14BI7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Tdrd9Q14BI7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Tdrd9Q14BI7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Tdrd9Q14BI7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Tdrd9Q14BI7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Tdrd9Q14BI7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Tdrd9Q14BI7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Tdrd9Q14BI7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Tdrd9Q14BI7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Tdrd9Q14BI7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Tdrd9Q14BI7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Tdrd9Q14BI7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Tdrd9Q14BI7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Tdrd9Q14BI7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Tdrd9Q14BI7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Tdrd9Q14BI7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms