Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Spatc1Q148B6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Spatc1Q148B6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spatc1Q148B6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Spatc1Q148B6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spatc1Q148B6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spatc1Q148B6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Spatc1Q148B6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spatc1Q148B6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spatc1Q148B6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spatc1Q148B6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spatc1Q148B6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Spatc1Q148B6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Spatc1Q148B6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Spatc1Q148B6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Spatc1Q148B6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spatc1Q148B6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms