Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 LINC00969-230ENST00000597034 731 ntTSL 56.74□□□□□ -1.332e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-272ENST00000626569 857 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.362e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-278ENST00000626870 851 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.362e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-225ENST00000594715 729 ntTSL 56.4□□□□□ -1.382e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-216ENST00000451228 604 ntTSL 36.01□□□□□ -1.452e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-275ENST00000626677 378 ntTSL 55.94□□□□□ -1.462e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-274ENST00000626617 1014 ntTSL 55.64□□□□□ -1.512e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-327ENST00000630417 918 ntTSL 55.55□□□□□ -1.522e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-290ENST00000627502 874 ntTSL 55.53□□□□□ -1.522e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-304ENST00000628301 772 ntTSL 55.31□□□□□ -1.562e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-293ENST00000627562 1184 ntTSL 55.27□□□□□ -1.572e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-335ENST00000631105 702 ntTSL 55.25□□□□□ -1.572e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-215ENST00000451216 405 ntTSL 55.14□□□□□ -1.592e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-259ENST00000625776 911 ntTSL 55.1□□□□□ -1.592e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-208ENST00000431767 486 ntTSL 54.94□□□□□ -1.622e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-288ENST00000627363 731 ntTSL 54.91□□□□□ -1.622e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-324ENST00000630243 955 ntTSL 54.84□□□□□ -1.632e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-250ENST00000615493 712 ntTSL 54.6□□□□□ -1.672e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-308ENST00000628547 882 ntTSL 54.48□□□□□ -1.692e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 LINC00969-317ENST00000629686 669 ntTSL 54.43□□□□□ -1.72e-7■■■■□ 24.3
SRSF9Q13242 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.179e-8■■■■□ 24.2
SRSF9Q13242 KAT2A-202ENST00000465682 2990 ntTSL 59.03□□□□□ -0.969e-8■■■■□ 24.2
SRSF9Q13242 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.174e-7■■■■□ 24.2
SRSF9Q13242 PRODH2-204ENST00000588266 567 ntTSL 39.61□□□□□ -0.874e-7■■■■□ 24.2
SRSF9Q13242 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.264e-7■■■■□ 24.2
SRSF9Q13242 AC004381.2-201ENST00000637768 1329 ntBASIC6.19□□□□□ -1.424e-6■■■■□ 24.2
SRSF9Q13242 CPE-205ENST00000513982 564 ntTSL 44.91□□□□□ -1.624e-7■■■■□ 24.2
SRSF9Q13242 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.013e-7■■■■□ 24.1
SRSF9Q13242 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.253e-7■■■■□ 24.1
SRSF9Q13242 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.483e-7■■■■□ 24.1
SRSF9Q13242 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.663e-7■■■■□ 24.1
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SRSF9Q13242 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.743e-7■■■■□ 24.1
SRSF9Q13242 LENG8-203ENST00000421200 594 ntTSL 310.29□□□□□ -0.763e-7■■■■□ 24.1
SRSF9Q13242 GIGYF2-202ENST00000409196 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -13e-7■■■■□ 24.1
SRSF9Q13242 GIGYF2-216ENST00000428883 544 ntTSL 48.77□□□□□ -1.013e-7■■■■□ 24.1
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SRSF9Q13242 GIGYF2-209ENST00000423659 2329 ntTSL 58.42□□□□□ -1.063e-7■■■■□ 24.1
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SRSF9Q13242 GIGYF2-243ENST00000490229 863 ntTSL 57.03□□□□□ -1.283e-7■■■■□ 24.1
SRSF9Q13242 GIGYF2-220ENST00000440945 2658 ntTSL 1 (best)6.88□□□□□ -1.313e-7■■■■□ 24.1
SRSF9Q13242 GIGYF2-218ENST00000430720 561 ntTSL 46.58□□□□□ -1.363e-7■■■■□ 24.1
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SRSF9Q13242 IGF2BP3-208ENST00000469723 556 ntTSL 55.74□□□□□ -1.492e-7■■■■□ 24.1
SRSF9Q13242 DOK6-201ENST00000382713 8890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.895e-9■■■■□ 24
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SRSF9Q13242 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.472e-6■■■■□ 23.9
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SRSF9Q13242 ZC3H11A-208ENST00000466470 944 ntTSL 25.73□□□□□ -1.492e-6■■■■□ 23.9
SRSF9Q13242 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.542e-6■■■■□ 23.9
SRSF9Q13242 ZC3H11A-207ENST00000461980 822 ntTSL 25.14□□□□□ -1.592e-6■■■■□ 23.9
SRSF9Q13242 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.622e-6■■■■□ 23.9
SRSF9Q13242 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.632e-6■■■■□ 23.9
SRSF9Q13242 ZC3H11A-213ENST00000638800 7078 ntTSL 54.23□□□□□ -1.732e-6■■■■□ 23.9
SRSF9Q13242 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.892e-6■■■■□ 23.9
SRSF9Q13242 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 23.8
SRSF9Q13242 EXOC3L4-202ENST00000559116 460 ntTSL 510.36□□□□□ -0.752e-6■■■■□ 23.8
SRSF9Q13242 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 23.8
SRSF9Q13242 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.651e-6■■■■□ 23.8
SRSF9Q13242 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.881e-6■■■■□ 23.8
SRSF9Q13242 AHSG-201ENST00000273784 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.035e-7■■■■□ 23.8
SRSF9Q13242 AHSG-203ENST00000478441 1269 ntTSL 28.14□□□□□ -1.115e-7■■■■□ 23.8
SRSF9Q13242 AHSG-202ENST00000411641 1711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.155e-7■■■■□ 23.8
SRSF9Q13242 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.296e-8■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.566e-8■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.66e-8■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 NEDD4L-201ENST00000256830 2920 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.26e-8■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.26e-8■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 GOSR2-228ENST00000639388 2514 ntTSL 512.29□□□□□ -0.442e-7■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.452e-7■■■■□ 23.6
SRSF9Q13242 GOSR2-236ENST00000640358 2313 ntTSL 511.95□□□□□ -0.52e-7■■■■□ 23.6
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