Protein–RNA interactions for Protein: Q12463

TRM11, tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM11Q12463 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt9.7□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt9.7□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt9.7□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt9.7□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt9.7□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 YER152W-AYER152W-A 567 nt9.7□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 YPS3YLR121C 1527 nt9.7□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 RSC8YFR037C 1674 nt9.7□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 QDR2YIL121W 1629 nt9.69□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 ACO2YJL200C 2370 nt9.68□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 FMS1YMR020W 1527 nt9.68□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.67□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 CDD1YLR245C 429 nt9.67□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 KRE1YNL322C 942 nt9.67□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 YGL114WYGL114W 2178 nt9.67□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 HEM13YDR044W 987 nt9.66□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 NAS2YIL007C 663 nt9.65□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 SPP2YOR148C 558 nt9.63□□□□□ -0.87
TRM11Q12463 YOR325WYOR325W 474 nt9.62□□□□□ -0.87
TRM11Q12463 SWM1YDR260C 513 nt9.61□□□□□ -0.87
TRM11Q12463 RRT8YOL048C 1029 nt9.61□□□□□ -0.87
TRM11Q12463 TAT2YOL020W 1779 nt9.6□□□□□ -0.87
TRM11Q12463 LYS20YDL182W 1287 nt9.6□□□□□ -0.87
TRM11Q12463 YDR455CYDR455C 309 nt9.6□□□□□ -0.87
TRM11Q12463 ABZ2YMR289W 1125 nt9.6□□□□□ -0.87
TRM11Q12463 ADE8YDR408C 645 nt9.59□□□□□ -0.87
TRM11Q12463 FLX1YIL134W 936 nt9.59□□□□□ -0.87
TRM11Q12463 BUD20YLR074C 501 nt9.59□□□□□ -0.87
TRM11Q12463 THP3YPR045C 1413 nt9.57□□□□□ -0.88
TRM11Q12463 TVP23YDR084C 600 nt9.57□□□□□ -0.88
TRM11Q12463 ILV3YJR016C 1758 nt9.57□□□□□ -0.88
TRM11Q12463 CWC15YDR163W 528 nt9.56□□□□□ -0.88
TRM11Q12463 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.56□□□□□ -0.88
TRM11Q12463 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.56□□□□□ -0.88
TRM11Q12463 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.56□□□□□ -0.88
TRM11Q12463 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.56□□□□□ -0.88
TRM11Q12463 SPE2YOL052C 1191 nt9.56□□□□□ -0.88
TRM11Q12463 ERG13YML126C 1476 nt9.53□□□□□ -0.88
TRM11Q12463 YMR007WYMR007W 381 nt9.53□□□□□ -0.88
TRM11Q12463 ACH1YBL015W 1581 nt9.53□□□□□ -0.88
TRM11Q12463 PHB2YGR231C 933 nt9.51□□□□□ -0.89
TRM11Q12463 ADH3YMR083W 1128 nt9.51□□□□□ -0.89
TRM11Q12463 VPS62YGR141W 1404 nt9.5□□□□□ -0.89
TRM11Q12463 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.5□□□□□ -0.89
TRM11Q12463 FSH2YMR222C 672 nt9.5□□□□□ -0.89
TRM11Q12463 SER2YGR208W 930 nt9.49□□□□□ -0.89
TRM11Q12463 RCR1YBR005W 642 nt9.49□□□□□ -0.89
TRM11Q12463 MOB1YIL106W 945 nt9.48□□□□□ -0.89
TRM11Q12463 OPI3YJR073C 621 nt9.47□□□□□ -0.89
TRM11Q12463 ENO2YHR174W 1314 nt9.47□□□□□ -0.89
TRM11Q12463 MAE1YKL029C 2010 nt9.46□□□□□ -0.89
TRM11Q12463 CYC3YAL039C 810 nt9.46□□□□□ -0.9
TRM11Q12463 BET2YPR176C 978 nt9.46□□□□□ -0.9
TRM11Q12463 COQ8YGL119W 1506 nt9.46□□□□□ -0.9
TRM11Q12463 UGP1YKL035W 1500 nt9.45□□□□□ -0.9
TRM11Q12463 TPC1YGR096W 945 nt9.44□□□□□ -0.9
TRM11Q12463 ARO8YGL202W 1503 nt9.44□□□□□ -0.9
TRM11Q12463 YMR209CYMR209C 1374 nt9.43□□□□□ -0.9
TRM11Q12463 YDL086WYDL086W 822 nt9.43□□□□□ -0.9
TRM11Q12463 OPI10YOL032W 741 nt9.43□□□□□ -0.9
TRM11Q12463 HTS1YPR033C 1641 nt9.42□□□□□ -0.9
TRM11Q12463 CCT2YIL142W 1584 nt9.41□□□□□ -0.9
TRM11Q12463 AMF1YOR378W 1548 nt9.41□□□□□ -0.9
TRM11Q12463 YOR343CYOR343C 327 nt9.41□□□□□ -0.9
TRM11Q12463 YKR012CYKR012C 378 nt9.4□□□□□ -0.9
TRM11Q12463 DIG1YPL049C 1359 nt9.39□□□□□ -0.91
TRM11Q12463 PAU21YOR394W 495 nt9.39□□□□□ -0.91
TRM11Q12463 PAU22YPL282C 495 nt9.39□□□□□ -0.91
TRM11Q12463 LSB6YJL100W 1824 nt9.38□□□□□ -0.91
TRM11Q12463 HIS2YFR025C 1008 nt9.38□□□□□ -0.91
TRM11Q12463 AIM1YAL046C 357 nt9.38□□□□□ -0.91
TRM11Q12463 SAC7YDR389W 1965 nt9.37□□□□□ -0.91
TRM11Q12463 RPL12BYDR418W 498 nt9.37□□□□□ -0.91
TRM11Q12463 PCP1YGR101W 1041 nt9.37□□□□□ -0.91
TRM11Q12463 LEU2YCL018W 1095 nt9.37□□□□□ -0.91
TRM11Q12463 KES1YPL145C 1305 nt9.36□□□□□ -0.91
TRM11Q12463 TGA1tA(UGC)A 73 nt9.36□□□□□ -0.91
TRM11Q12463 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt9.36□□□□□ -0.91
TRM11Q12463 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt9.36□□□□□ -0.91
TRM11Q12463 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt9.36□□□□□ -0.91
TRM11Q12463 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt9.36□□□□□ -0.91
TRM11Q12463 SGA1YIL099W 1650 nt9.36□□□□□ -0.91
TRM11Q12463 YGR210CYGR210C 1236 nt9.34□□□□□ -0.91
TRM11Q12463 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt9.34□□□□□ -0.91
TRM11Q12463 HRA1HRA1 564 nt9.33□□□□□ -0.92
TRM11Q12463 SRP102YKL154W 735 nt9.33□□□□□ -0.92
TRM11Q12463 FCY1YPR062W 477 nt9.33□□□□□ -0.92
TRM11Q12463 ZAP1YJL056C 2643 nt9.33□□□□□ -0.92
TRM11Q12463 SDS24YBR214W 1584 nt9.33□□□□□ -0.92
TRM11Q12463 YNR064CYNR064C 873 nt9.32□□□□□ -0.92
TRM11Q12463 ENO1YGR254W 1314 nt9.31□□□□□ -0.92
TRM11Q12463 GRH1YDR517W 1119 nt9.31□□□□□ -0.92
TRM11Q12463 ENT4YLL038C 744 nt9.31□□□□□ -0.92
TRM11Q12463 NAM8YHR086W 1572 nt9.31□□□□□ -0.92
TRM11Q12463 ERO1YML130C 1692 nt9.31□□□□□ -0.92
TRM11Q12463 YLR280CYLR280C 351 nt9.3□□□□□ -0.92
TRM11Q12463 YOR268CYOR268C 399 nt9.26□□□□□ -0.93
TRM11Q12463 VBA3YCL069W 1377 nt9.25□□□□□ -0.93
TRM11Q12463 EMC3YKL207W 762 nt9.24□□□□□ -0.93
TRM11Q12463 YLR046CYLR046C 813 nt9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.8 ms