Protein–RNA interactions for Protein: Q12255

NYV1, Vacuolar v-SNARE NYV1, yeastyeast

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NYV1Q12255 RPL12BYDR418W 498 nt10.75□□□□□ -0.69
NYV1Q12255 YMR007WYMR007W 381 nt10.73□□□□□ -0.69
NYV1Q12255 ABZ2YMR289W 1125 nt10.73□□□□□ -0.69
NYV1Q12255 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.72□□□□□ -0.69
NYV1Q12255 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.72□□□□□ -0.69
NYV1Q12255 ADH3YMR083W 1128 nt10.72□□□□□ -0.69
NYV1Q12255 YOR343CYOR343C 327 nt10.72□□□□□ -0.69
NYV1Q12255 THP3YPR045C 1413 nt10.72□□□□□ -0.69
NYV1Q12255 BIO5YNR056C 1686 nt10.72□□□□□ -0.69
NYV1Q12255 ADE8YDR408C 645 nt10.71□□□□□ -0.69
NYV1Q12255 PHB2YGR231C 933 nt10.71□□□□□ -0.69
NYV1Q12255 SPP2YOR148C 558 nt10.71□□□□□ -0.69
NYV1Q12255 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt10.69□□□□□ -0.7
NYV1Q12255 RRT8YOL048C 1029 nt10.69□□□□□ -0.7
NYV1Q12255 YOR268CYOR268C 399 nt10.69□□□□□ -0.7
NYV1Q12255 TVP23YDR084C 600 nt10.68□□□□□ -0.7
NYV1Q12255 SER2YGR208W 930 nt10.68□□□□□ -0.7
NYV1Q12255 YJL067WYJL067W 351 nt10.68□□□□□ -0.7
NYV1Q12255 RCR1YBR005W 642 nt10.68□□□□□ -0.7
NYV1Q12255 TOS1YBR162C 1368 nt10.67□□□□□ -0.7
NYV1Q12255 MOB1YIL106W 945 nt10.67□□□□□ -0.7
NYV1Q12255 ERG13YML126C 1476 nt10.66□□□□□ -0.7
NYV1Q12255 PAU21YOR394W 495 nt10.65□□□□□ -0.7
NYV1Q12255 PAU22YPL282C 495 nt10.65□□□□□ -0.7
NYV1Q12255 MFG1YDL233W 1377 nt10.64□□□□□ -0.71
NYV1Q12255 ASP3-1YLR155C 1089 nt10.63□□□□□ -0.71
NYV1Q12255 ASP3-2YLR157C 1089 nt10.63□□□□□ -0.71
NYV1Q12255 ASP3-3YLR158C 1089 nt10.63□□□□□ -0.71
NYV1Q12255 ASP3-4YLR160C 1089 nt10.63□□□□□ -0.71
NYV1Q12255 CYC3YAL039C 810 nt10.62□□□□□ -0.71
NYV1Q12255 BET2YPR176C 978 nt10.61□□□□□ -0.71
NYV1Q12255 TPC1YGR096W 945 nt10.6□□□□□ -0.71
NYV1Q12255 OPI3YJR073C 621 nt10.6□□□□□ -0.71
NYV1Q12255 ACH1YBL015W 1581 nt10.6□□□□□ -0.71
NYV1Q12255 ENO2YHR174W 1314 nt10.59□□□□□ -0.71
NYV1Q12255 TGA1tA(UGC)A 73 nt10.59□□□□□ -0.71
NYV1Q12255 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt10.59□□□□□ -0.71
NYV1Q12255 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt10.59□□□□□ -0.71
NYV1Q12255 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt10.59□□□□□ -0.71
NYV1Q12255 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt10.59□□□□□ -0.71
NYV1Q12255 CWC15YDR163W 528 nt10.59□□□□□ -0.71
NYV1Q12255 HRA1HRA1 564 nt10.59□□□□□ -0.71
NYV1Q12255 FSH2YMR222C 672 nt10.59□□□□□ -0.71
NYV1Q12255 HTS1YPR033C 1641 nt10.58□□□□□ -0.72
NYV1Q12255 PCP1YGR101W 1041 nt10.58□□□□□ -0.72
NYV1Q12255 YKR012CYKR012C 378 nt10.56□□□□□ -0.72
NYV1Q12255 FCY1YPR062W 477 nt10.56□□□□□ -0.72
NYV1Q12255 HOG1YLR113W 1308 nt10.56□□□□□ -0.72
NYV1Q12255 GRH1YDR517W 1119 nt10.55□□□□□ -0.72
NYV1Q12255 YGR210CYGR210C 1236 nt10.53□□□□□ -0.72
NYV1Q12255 VPS62YGR141W 1404 nt10.52□□□□□ -0.73
NYV1Q12255 AMF1YOR378W 1548 nt10.51□□□□□ -0.73
NYV1Q12255 DIG1YPL049C 1359 nt10.51□□□□□ -0.73
NYV1Q12255 SAC7YDR389W 1965 nt10.46□□□□□ -0.73
NYV1Q12255 EMC3YKL207W 762 nt10.46□□□□□ -0.73
NYV1Q12255 YLR280CYLR280C 351 nt10.46□□□□□ -0.73
NYV1Q12255 ERO1YML130C 1692 nt10.46□□□□□ -0.74
NYV1Q12255 SDS24YBR214W 1584 nt10.45□□□□□ -0.74
NYV1Q12255 LEU2YCL018W 1095 nt10.45□□□□□ -0.74
NYV1Q12255 AIM1YAL046C 357 nt10.44□□□□□ -0.74
NYV1Q12255 LSB6YJL100W 1824 nt10.44□□□□□ -0.74
NYV1Q12255 NAM8YHR086W 1572 nt10.43□□□□□ -0.74
NYV1Q12255 SRP102YKL154W 735 nt10.43□□□□□ -0.74
NYV1Q12255 ENO1YGR254W 1314 nt10.42□□□□□ -0.74
NYV1Q12255 YDL086WYDL086W 822 nt10.42□□□□□ -0.74
NYV1Q12255 YMR206WYMR206W 942 nt10.42□□□□□ -0.74
NYV1Q12255 KAE1YKR038C 1161 nt10.4□□□□□ -0.74
NYV1Q12255 VBA3YCL069W 1377 nt10.39□□□□□ -0.75
NYV1Q12255 YJL160CYJL160C 864 nt10.38□□□□□ -0.75
NYV1Q12255 YNR064CYNR064C 873 nt10.37□□□□□ -0.75
NYV1Q12255 YPL108WYPL108W 507 nt10.37□□□□□ -0.75
NYV1Q12255 EDC2YER035W 438 nt10.36□□□□□ -0.75
NYV1Q12255 ALG12YNR030W 1656 nt10.36□□□□□ -0.75
NYV1Q12255 YMR210WYMR210W 1350 nt10.36□□□□□ -0.75
NYV1Q12255 MRP1YDR347W 966 nt10.35□□□□□ -0.75
NYV1Q12255 PBP1YGR178C 2169 nt10.34□□□□□ -0.75
NYV1Q12255 ELO1YJL196C 933 nt10.32□□□□□ -0.76
NYV1Q12255 SDH8YBR269C 417 nt10.32□□□□□ -0.76
NYV1Q12255 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.31□□□□□ -0.76
NYV1Q12255 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.31□□□□□ -0.76
NYV1Q12255 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt10.29□□□□□ -0.76
NYV1Q12255 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt10.29□□□□□ -0.76
NYV1Q12255 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt10.29□□□□□ -0.76
NYV1Q12255 SUP51tL(UAA)J 84 nt10.29□□□□□ -0.76
NYV1Q12255 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt10.29□□□□□ -0.76
NYV1Q12255 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt10.29□□□□□ -0.76
NYV1Q12255 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt10.29□□□□□ -0.76
NYV1Q12255 ENT4YLL038C 744 nt10.29□□□□□ -0.76
NYV1Q12255 REX2YLR059C 810 nt10.29□□□□□ -0.76
NYV1Q12255 BSP1YPR171W 1731 nt10.28□□□□□ -0.76
NYV1Q12255 SWT21YNL187W 1074 nt10.28□□□□□ -0.76
NYV1Q12255 SFL1YOR140W 2301 nt10.27□□□□□ -0.77
NYV1Q12255 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.26□□□□□ -0.77
NYV1Q12255 RIM2YBR192W 1134 nt10.26□□□□□ -0.77
NYV1Q12255 KEL3YPL263C 1956 nt10.25□□□□□ -0.77
NYV1Q12255 YKL053WYKL053W 375 nt10.25□□□□□ -0.77
NYV1Q12255 YLR046CYLR046C 813 nt10.25□□□□□ -0.77
NYV1Q12255 YPL247CYPL247C 1572 nt10.24□□□□□ -0.77
NYV1Q12255 GDH1YOR375C 1365 nt10.24□□□□□ -0.77
NYV1Q12255 MET1YKR069W 1782 nt10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.2 ms