Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cntn3Q07409 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cntn3Q07409 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cntn3Q07409 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cntn3Q07409 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cntn3Q07409 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cntn3Q07409 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cntn3Q07409 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntn3Q07409 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntn3Q07409 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntn3Q07409 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntn3Q07409 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cntn3Q07409 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cntn3Q07409 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cntn3Q07409 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cntn3Q07409 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cntn3Q07409 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cntn3Q07409 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cntn3Q07409 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntn3Q07409 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntn3Q07409 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntn3Q07409 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cntn3Q07409 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cntn3Q07409 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cntn3Q07409 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cntn3Q07409 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cntn3Q07409 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cntn3Q07409 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cntn3Q07409 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cntn3Q07409 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntn3Q07409 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntn3Q07409 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntn3Q07409 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntn3Q07409 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntn3Q07409 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntn3Q07409 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cntn3Q07409 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cntn3Q07409 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cntn3Q07409 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cntn3Q07409 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cntn3Q07409 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntn3Q07409 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntn3Q07409 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntn3Q07409 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntn3Q07409 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cntn3Q07409 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cntn3Q07409 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cntn3Q07409 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cntn3Q07409 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cntn3Q07409 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cntn3Q07409 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cntn3Q07409 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cntn3Q07409 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cntn3Q07409 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cntn3Q07409 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cntn3Q07409 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cntn3Q07409 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntn3Q07409 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntn3Q07409 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cntn3Q07409 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cntn3Q07409 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cntn3Q07409 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cntn3Q07409 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cntn3Q07409 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cntn3Q07409 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cntn3Q07409 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cntn3Q07409 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cntn3Q07409 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cntn3Q07409 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cntn3Q07409 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntn3Q07409 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntn3Q07409 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntn3Q07409 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cntn3Q07409 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cntn3Q07409 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cntn3Q07409 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cntn3Q07409 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cntn3Q07409 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntn3Q07409 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cntn3Q07409 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntn3Q07409 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntn3Q07409 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntn3Q07409 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntn3Q07409 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntn3Q07409 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cntn3Q07409 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntn3Q07409 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cntn3Q07409 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cntn3Q07409 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cntn3Q07409 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cntn3Q07409 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cntn3Q07409 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cntn3Q07409 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cntn3Q07409 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cntn3Q07409 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cntn3Q07409 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cntn3Q07409 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cntn3Q07409 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Cntn3Q07409 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cntn3Q07409 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms