Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Muc1Q02496 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Muc1Q02496 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Muc1Q02496 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Muc1Q02496 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Muc1Q02496 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Muc1Q02496 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Muc1Q02496 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Muc1Q02496 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Muc1Q02496 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Muc1Q02496 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Muc1Q02496 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Muc1Q02496 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Muc1Q02496 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Muc1Q02496 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Muc1Q02496 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Muc1Q02496 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Muc1Q02496 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Muc1Q02496 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Muc1Q02496 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Muc1Q02496 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Muc1Q02496 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Muc1Q02496 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Muc1Q02496 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Muc1Q02496 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Muc1Q02496 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Muc1Q02496 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Muc1Q02496 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Muc1Q02496 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Muc1Q02496 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Muc1Q02496 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Muc1Q02496 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Muc1Q02496 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Muc1Q02496 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Muc1Q02496 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Muc1Q02496 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Muc1Q02496 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Muc1Q02496 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Muc1Q02496 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Muc1Q02496 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Muc1Q02496 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Muc1Q02496 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Muc1Q02496 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Muc1Q02496 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Muc1Q02496 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Muc1Q02496 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Muc1Q02496 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Muc1Q02496 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Muc1Q02496 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Muc1Q02496 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Muc1Q02496 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Muc1Q02496 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Muc1Q02496 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Muc1Q02496 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Muc1Q02496 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Muc1Q02496 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Muc1Q02496 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Muc1Q02496 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Muc1Q02496 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Muc1Q02496 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Muc1Q02496 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Muc1Q02496 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Muc1Q02496 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Muc1Q02496 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Muc1Q02496 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Muc1Q02496 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Muc1Q02496 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Muc1Q02496 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Muc1Q02496 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Muc1Q02496 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Muc1Q02496 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Muc1Q02496 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Muc1Q02496 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Muc1Q02496 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Muc1Q02496 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Muc1Q02496 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Muc1Q02496 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Muc1Q02496 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Muc1Q02496 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Muc1Q02496 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Muc1Q02496 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Muc1Q02496 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Muc1Q02496 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Muc1Q02496 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Muc1Q02496 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Muc1Q02496 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Muc1Q02496 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Muc1Q02496 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Muc1Q02496 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Muc1Q02496 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Muc1Q02496 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Muc1Q02496 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Muc1Q02496 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Muc1Q02496 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Muc1Q02496 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Muc1Q02496 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Muc1Q02496 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Muc1Q02496 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Muc1Q02496 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Muc1Q02496 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms