Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stx2Q00262 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx2Q00262 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx2Q00262 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Stx2Q00262 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Stx2Q00262 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx2Q00262 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx2Q00262 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx2Q00262 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx2Q00262 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx2Q00262 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx2Q00262 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx2Q00262 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Stx2Q00262 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Stx2Q00262 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Stx2Q00262 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx2Q00262 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx2Q00262 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Stx2Q00262 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx2Q00262 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx2Q00262 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx2Q00262 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Stx2Q00262 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stx2Q00262 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stx2Q00262 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stx2Q00262 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Stx2Q00262 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx2Q00262 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx2Q00262 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx2Q00262 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx2Q00262 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx2Q00262 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stx2Q00262 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx2Q00262 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stx2Q00262 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx2Q00262 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stx2Q00262 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx2Q00262 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stx2Q00262 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stx2Q00262 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Stx2Q00262 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stx2Q00262 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx2Q00262 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stx2Q00262 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx2Q00262 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx2Q00262 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stx2Q00262 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx2Q00262 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Stx2Q00262 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx2Q00262 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx2Q00262 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Stx2Q00262 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stx2Q00262 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stx2Q00262 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Stx2Q00262 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Stx2Q00262 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx2Q00262 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx2Q00262 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stx2Q00262 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx2Q00262 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Stx2Q00262 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms