Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brca2P97929 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brca2P97929 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brca2P97929 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brca2P97929 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brca2P97929 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brca2P97929 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brca2P97929 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brca2P97929 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brca2P97929 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brca2P97929 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brca2P97929 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brca2P97929 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brca2P97929 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brca2P97929 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brca2P97929 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brca2P97929 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brca2P97929 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brca2P97929 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brca2P97929 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brca2P97929 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brca2P97929 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Brca2P97929 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brca2P97929 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Brca2P97929 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Brca2P97929 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Brca2P97929 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Brca2P97929 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brca2P97929 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brca2P97929 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brca2P97929 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brca2P97929 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brca2P97929 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brca2P97929 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brca2P97929 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brca2P97929 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brca2P97929 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brca2P97929 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brca2P97929 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brca2P97929 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brca2P97929 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brca2P97929 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brca2P97929 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brca2P97929 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brca2P97929 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brca2P97929 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brca2P97929 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brca2P97929 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brca2P97929 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brca2P97929 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brca2P97929 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brca2P97929 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brca2P97929 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brca2P97929 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brca2P97929 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brca2P97929 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brca2P97929 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brca2P97929 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brca2P97929 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brca2P97929 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brca2P97929 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Brca2P97929 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Brca2P97929 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brca2P97929 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brca2P97929 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Brca2P97929 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brca2P97929 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brca2P97929 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brca2P97929 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brca2P97929 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brca2P97929 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brca2P97929 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brca2P97929 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brca2P97929 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brca2P97929 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Brca2P97929 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brca2P97929 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Brca2P97929 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brca2P97929 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brca2P97929 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brca2P97929 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brca2P97929 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brca2P97929 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brca2P97929 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brca2P97929 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Brca2P97929 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Brca2P97929 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Brca2P97929 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Brca2P97929 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Brca2P97929 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Brca2P97929 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brca2P97929 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brca2P97929 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brca2P97929 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Brca2P97929 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brca2P97929 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brca2P97929 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Brca2P97929 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Brca2P97929 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Brca2P97929 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms