Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tarbp2P97473 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tarbp2P97473 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tarbp2P97473 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tarbp2P97473 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tarbp2P97473 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tarbp2P97473 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp2P97473 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Tarbp2P97473 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tarbp2P97473 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tarbp2P97473 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tarbp2P97473 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tarbp2P97473 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tarbp2P97473 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tarbp2P97473 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tarbp2P97473 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Tarbp2P97473 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tarbp2P97473 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27■■□□□ 1.91
Tarbp2P97473 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tarbp2P97473 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tarbp2P97473 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tarbp2P97473 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tarbp2P97473 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tarbp2P97473 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tarbp2P97473 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tarbp2P97473 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tarbp2P97473 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tarbp2P97473 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Tarbp2P97473 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tarbp2P97473 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tarbp2P97473 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tarbp2P97473 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tarbp2P97473 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tarbp2P97473 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tarbp2P97473 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tarbp2P97473 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tarbp2P97473 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tarbp2P97473 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tarbp2P97473 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tarbp2P97473 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tarbp2P97473 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tarbp2P97473 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tarbp2P97473 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tarbp2P97473 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tarbp2P97473 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tarbp2P97473 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tarbp2P97473 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tarbp2P97473 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tarbp2P97473 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tarbp2P97473 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Tarbp2P97473 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tarbp2P97473 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tarbp2P97473 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tarbp2P97473 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp2P97473 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp2P97473 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp2P97473 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp2P97473 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp2P97473 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tarbp2P97473 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tarbp2P97473 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tarbp2P97473 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tarbp2P97473 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tarbp2P97473 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tarbp2P97473 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tarbp2P97473 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tarbp2P97473 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tarbp2P97473 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tarbp2P97473 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tarbp2P97473 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tarbp2P97473 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tarbp2P97473 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tarbp2P97473 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tarbp2P97473 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tarbp2P97473 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tarbp2P97473 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tarbp2P97473 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tarbp2P97473 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tarbp2P97473 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tarbp2P97473 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tarbp2P97473 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Tarbp2P97473 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tarbp2P97473 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tarbp2P97473 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tarbp2P97473 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tarbp2P97473 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tarbp2P97473 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tarbp2P97473 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tarbp2P97473 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tarbp2P97473 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Tarbp2P97473 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tarbp2P97473 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Tarbp2P97473 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tarbp2P97473 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tarbp2P97473 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tarbp2P97473 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tarbp2P97473 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tarbp2P97473 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tarbp2P97473 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Tarbp2P97473 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms