Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxb13P70321 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxb13P70321 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxb13P70321 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxb13P70321 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxb13P70321 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hoxb13P70321 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxb13P70321 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxb13P70321 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxb13P70321 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxb13P70321 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxb13P70321 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxb13P70321 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxb13P70321 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxb13P70321 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxb13P70321 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxb13P70321 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxb13P70321 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxb13P70321 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxb13P70321 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxb13P70321 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxb13P70321 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxb13P70321 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxb13P70321 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxb13P70321 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxb13P70321 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxb13P70321 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxb13P70321 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxb13P70321 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxb13P70321 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hoxb13P70321 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxb13P70321 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxb13P70321 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxb13P70321 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxb13P70321 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxb13P70321 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxb13P70321 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxb13P70321 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hoxb13P70321 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxb13P70321 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxb13P70321 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxb13P70321 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxb13P70321 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hoxb13P70321 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hoxb13P70321 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxb13P70321 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxb13P70321 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxb13P70321 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxb13P70321 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxb13P70321 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxb13P70321 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxb13P70321 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxb13P70321 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxb13P70321 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxb13P70321 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxb13P70321 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxb13P70321 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxb13P70321 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxb13P70321 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxb13P70321 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxb13P70321 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxb13P70321 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxb13P70321 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxb13P70321 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxb13P70321 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxb13P70321 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxb13P70321 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxb13P70321 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hoxb13P70321 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxb13P70321 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxb13P70321 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hoxb13P70321 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxb13P70321 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxb13P70321 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxb13P70321 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxb13P70321 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxb13P70321 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxb13P70321 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxb13P70321 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxb13P70321 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms