Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps28P62858 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rps28P62858 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rps28P62858 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rps28P62858 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps28P62858 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rps28P62858 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rps28P62858 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps28P62858 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rps28P62858 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps28P62858 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rps28P62858 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rps28P62858 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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