Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkn2bP55271 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkn2bP55271 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkn2bP55271 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdkn2bP55271 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkn2bP55271 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkn2bP55271 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdkn2bP55271 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkn2bP55271 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkn2bP55271 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkn2bP55271 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn2bP55271 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn2bP55271 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn2bP55271 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkn2bP55271 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkn2bP55271 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkn2bP55271 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdkn2bP55271 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkn2bP55271 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkn2bP55271 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkn2bP55271 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdkn2bP55271 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdkn2bP55271 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdkn2bP55271 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cdkn2bP55271 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkn2bP55271 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkn2bP55271 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkn2bP55271 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdkn2bP55271 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkn2bP55271 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkn2bP55271 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkn2bP55271 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkn2bP55271 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdkn2bP55271 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdkn2bP55271 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdkn2bP55271 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdkn2bP55271 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdkn2bP55271 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdkn2bP55271 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdkn2bP55271 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdkn2bP55271 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkn2bP55271 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkn2bP55271 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkn2bP55271 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkn2bP55271 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdkn2bP55271 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdkn2bP55271 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdkn2bP55271 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdkn2bP55271 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdkn2bP55271 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdkn2bP55271 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdkn2bP55271 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdkn2bP55271 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdkn2bP55271 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdkn2bP55271 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdkn2bP55271 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdkn2bP55271 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkn2bP55271 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkn2bP55271 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkn2bP55271 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdkn2bP55271 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkn2bP55271 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdkn2bP55271 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdkn2bP55271 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdkn2bP55271 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdkn2bP55271 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdkn2bP55271 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdkn2bP55271 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdkn2bP55271 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdkn2bP55271 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdkn2bP55271 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdkn2bP55271 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdkn2bP55271 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdkn2bP55271 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdkn2bP55271 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdkn2bP55271 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdkn2bP55271 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms