Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CnbpP53996 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CnbpP53996 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CnbpP53996 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CnbpP53996 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CnbpP53996 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CnbpP53996 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CnbpP53996 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CnbpP53996 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CnbpP53996 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CnbpP53996 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CnbpP53996 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CnbpP53996 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CnbpP53996 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CnbpP53996 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CnbpP53996 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CnbpP53996 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CnbpP53996 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CnbpP53996 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CnbpP53996 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CnbpP53996 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CnbpP53996 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CnbpP53996 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CnbpP53996 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CnbpP53996 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CnbpP53996 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CnbpP53996 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CnbpP53996 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CnbpP53996 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CnbpP53996 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CnbpP53996 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CnbpP53996 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CnbpP53996 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CnbpP53996 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CnbpP53996 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CnbpP53996 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CnbpP53996 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CnbpP53996 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CnbpP53996 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CnbpP53996 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CnbpP53996 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CnbpP53996 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CnbpP53996 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CnbpP53996 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CnbpP53996 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CnbpP53996 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CnbpP53996 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.1 ms