Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Fgd1P52734 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Fgd1P52734 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fgd1P52734 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fgd1P52734 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fgd1P52734 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fgd1P52734 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fgd1P52734 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Fgd1P52734 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fgd1P52734 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fgd1P52734 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Fgd1P52734 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Fgd1P52734 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Fgd1P52734 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Fgd1P52734 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Fgd1P52734 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Fgd1P52734 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fgd1P52734 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fgd1P52734 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fgd1P52734 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Fgd1P52734 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Fgd1P52734 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Fgd1P52734 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Fgd1P52734 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Fgd1P52734 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fgd1P52734 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fgd1P52734 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Fgd1P52734 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Fgd1P52734 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Fgd1P52734 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Fgd1P52734 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Fgd1P52734 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fgd1P52734 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fgd1P52734 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Fgd1P52734 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Fgd1P52734 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Fgd1P52734 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Fgd1P52734 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Fgd1P52734 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fgd1P52734 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fgd1P52734 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Fgd1P52734 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Fgd1P52734 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Fgd1P52734 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Fgd1P52734 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Fgd1P52734 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Fgd1P52734 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Fgd1P52734 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Fgd1P52734 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Fgd1P52734 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Fgd1P52734 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Fgd1P52734 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Fgd1P52734 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fgd1P52734 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Fgd1P52734 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fgd1P52734 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fgd1P52734 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fgd1P52734 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fgd1P52734 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Fgd1P52734 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Fgd1P52734 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Fgd1P52734 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Fgd1P52734 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Fgd1P52734 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Fgd1P52734 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Fgd1P52734 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Fgd1P52734 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Fgd1P52734 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Fgd1P52734 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Fgd1P52734 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Fgd1P52734 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Fgd1P52734 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Fgd1P52734 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Fgd1P52734 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fgd1P52734 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Fgd1P52734 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Fgd1P52734 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms