Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rhox5P52651 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rhox5P52651 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rhox5P52651 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rhox5P52651 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rhox5P52651 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rhox5P52651 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rhox5P52651 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rhox5P52651 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rhox5P52651 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rhox5P52651 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rhox5P52651 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rhox5P52651 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rhox5P52651 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rhox5P52651 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rhox5P52651 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rhox5P52651 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rhox5P52651 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rhox5P52651 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rhox5P52651 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rhox5P52651 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rhox5P52651 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rhox5P52651 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rhox5P52651 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rhox5P52651 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rhox5P52651 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rhox5P52651 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rhox5P52651 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Rhox5P52651 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rhox5P52651 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rhox5P52651 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rhox5P52651 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rhox5P52651 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rhox5P52651 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rhox5P52651 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rhox5P52651 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rhox5P52651 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rhox5P52651 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rhox5P52651 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rhox5P52651 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rhox5P52651 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rhox5P52651 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rhox5P52651 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rhox5P52651 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rhox5P52651 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rhox5P52651 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rhox5P52651 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rhox5P52651 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rhox5P52651 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rhox5P52651 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rhox5P52651 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rhox5P52651 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rhox5P52651 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rhox5P52651 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rhox5P52651 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rhox5P52651 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rhox5P52651 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rhox5P52651 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rhox5P52651 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rhox5P52651 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rhox5P52651 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rhox5P52651 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rhox5P52651 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rhox5P52651 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rhox5P52651 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rhox5P52651 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rhox5P52651 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rhox5P52651 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rhox5P52651 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rhox5P52651 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rhox5P52651 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rhox5P52651 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rhox5P52651 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rhox5P52651 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhox5P52651 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhox5P52651 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhox5P52651 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhox5P52651 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rhox5P52651 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rhox5P52651 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rhox5P52651 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhox5P52651 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhox5P52651 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rhox5P52651 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rhox5P52651 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rhox5P52651 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhox5P52651 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhox5P52651 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhox5P52651 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhox5P52651 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rhox5P52651 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rhox5P52651 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rhox5P52651 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rhox5P52651 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rhox5P52651 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhox5P52651 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhox5P52651 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhox5P52651 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rhox5P52651 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rhox5P52651 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms