Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Csrp3P50462 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csrp3P50462 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csrp3P50462 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Csrp3P50462 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Csrp3P50462 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Csrp3P50462 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Csrp3P50462 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Csrp3P50462 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csrp3P50462 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csrp3P50462 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Csrp3P50462 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csrp3P50462 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csrp3P50462 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Csrp3P50462 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Csrp3P50462 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Csrp3P50462 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csrp3P50462 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csrp3P50462 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Csrp3P50462 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csrp3P50462 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Csrp3P50462 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Csrp3P50462 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Csrp3P50462 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Csrp3P50462 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csrp3P50462 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csrp3P50462 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csrp3P50462 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Csrp3P50462 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Csrp3P50462 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Csrp3P50462 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Csrp3P50462 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Csrp3P50462 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Csrp3P50462 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Csrp3P50462 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Csrp3P50462 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Csrp3P50462 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Csrp3P50462 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csrp3P50462 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Csrp3P50462 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Csrp3P50462 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Csrp3P50462 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Csrp3P50462 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csrp3P50462 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Csrp3P50462 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Csrp3P50462 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Csrp3P50462 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csrp3P50462 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Csrp3P50462 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csrp3P50462 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csrp3P50462 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Csrp3P50462 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csrp3P50462 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Csrp3P50462 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csrp3P50462 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Csrp3P50462 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms