Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptx3P48759 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptx3P48759 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptx3P48759 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptx3P48759 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptx3P48759 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptx3P48759 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptx3P48759 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptx3P48759 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptx3P48759 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptx3P48759 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptx3P48759 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptx3P48759 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptx3P48759 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptx3P48759 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptx3P48759 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptx3P48759 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptx3P48759 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptx3P48759 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptx3P48759 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptx3P48759 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptx3P48759 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptx3P48759 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptx3P48759 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ptx3P48759 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptx3P48759 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptx3P48759 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ptx3P48759 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ptx3P48759 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptx3P48759 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptx3P48759 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptx3P48759 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptx3P48759 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ptx3P48759 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptx3P48759 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ptx3P48759 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptx3P48759 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ptx3P48759 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ptx3P48759 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptx3P48759 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptx3P48759 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptx3P48759 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ptx3P48759 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptx3P48759 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ptx3P48759 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ptx3P48759 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ptx3P48759 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptx3P48759 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptx3P48759 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptx3P48759 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ptx3P48759 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptx3P48759 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ptx3P48759 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptx3P48759 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptx3P48759 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptx3P48759 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptx3P48759 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptx3P48759 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptx3P48759 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptx3P48759 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptx3P48759 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptx3P48759 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptx3P48759 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptx3P48759 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptx3P48759 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptx3P48759 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptx3P48759 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptx3P48759 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptx3P48759 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptx3P48759 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptx3P48759 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptx3P48759 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptx3P48759 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptx3P48759 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms