Protein–RNA interactions for Protein: P48722

Hspa4l, Heat shock 70 kDa protein 4L, mousemouse

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa4lP48722 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hspa4lP48722 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hspa4lP48722 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hspa4lP48722 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hspa4lP48722 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hspa4lP48722 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hspa4lP48722 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hspa4lP48722 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hspa4lP48722 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hspa4lP48722 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hspa4lP48722 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hspa4lP48722 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hspa4lP48722 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hspa4lP48722 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hspa4lP48722 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hspa4lP48722 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hspa4lP48722 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hspa4lP48722 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hspa4lP48722 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hspa4lP48722 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hspa4lP48722 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hspa4lP48722 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hspa4lP48722 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hspa4lP48722 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hspa4lP48722 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hspa4lP48722 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hspa4lP48722 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hspa4lP48722 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Hspa4lP48722 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hspa4lP48722 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hspa4lP48722 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hspa4lP48722 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hspa4lP48722 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hspa4lP48722 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hspa4lP48722 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hspa4lP48722 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hspa4lP48722 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hspa4lP48722 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hspa4lP48722 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hspa4lP48722 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hspa4lP48722 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hspa4lP48722 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hspa4lP48722 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Hspa4lP48722 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hspa4lP48722 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hspa4lP48722 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hspa4lP48722 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hspa4lP48722 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hspa4lP48722 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hspa4lP48722 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hspa4lP48722 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hspa4lP48722 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hspa4lP48722 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hspa4lP48722 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hspa4lP48722 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hspa4lP48722 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hspa4lP48722 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hspa4lP48722 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hspa4lP48722 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hspa4lP48722 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hspa4lP48722 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hspa4lP48722 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hspa4lP48722 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hspa4lP48722 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hspa4lP48722 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hspa4lP48722 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hspa4lP48722 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hspa4lP48722 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hspa4lP48722 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hspa4lP48722 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hspa4lP48722 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hspa4lP48722 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hspa4lP48722 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hspa4lP48722 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hspa4lP48722 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hspa4lP48722 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hspa4lP48722 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hspa4lP48722 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hspa4lP48722 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hspa4lP48722 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Hspa4lP48722 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hspa4lP48722 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hspa4lP48722 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hspa4lP48722 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hspa4lP48722 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hspa4lP48722 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hspa4lP48722 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hspa4lP48722 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hspa4lP48722 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hspa4lP48722 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hspa4lP48722 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hspa4lP48722 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hspa4lP48722 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hspa4lP48722 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hspa4lP48722 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hspa4lP48722 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hspa4lP48722 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hspa4lP48722 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hspa4lP48722 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hspa4lP48722 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms