Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sipa1P46062 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sipa1P46062 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sipa1P46062 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sipa1P46062 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sipa1P46062 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sipa1P46062 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sipa1P46062 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sipa1P46062 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sipa1P46062 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sipa1P46062 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sipa1P46062 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sipa1P46062 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sipa1P46062 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sipa1P46062 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sipa1P46062 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sipa1P46062 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sipa1P46062 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Sipa1P46062 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sipa1P46062 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sipa1P46062 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sipa1P46062 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sipa1P46062 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sipa1P46062 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sipa1P46062 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sipa1P46062 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sipa1P46062 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sipa1P46062 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sipa1P46062 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sipa1P46062 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sipa1P46062 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sipa1P46062 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sipa1P46062 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sipa1P46062 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sipa1P46062 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sipa1P46062 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sipa1P46062 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sipa1P46062 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sipa1P46062 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sipa1P46062 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sipa1P46062 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sipa1P46062 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sipa1P46062 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sipa1P46062 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sipa1P46062 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sipa1P46062 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sipa1P46062 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sipa1P46062 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sipa1P46062 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sipa1P46062 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sipa1P46062 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sipa1P46062 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sipa1P46062 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sipa1P46062 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sipa1P46062 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sipa1P46062 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sipa1P46062 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sipa1P46062 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sipa1P46062 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sipa1P46062 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sipa1P46062 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sipa1P46062 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sipa1P46062 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sipa1P46062 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sipa1P46062 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sipa1P46062 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sipa1P46062 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sipa1P46062 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sipa1P46062 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sipa1P46062 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sipa1P46062 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sipa1P46062 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sipa1P46062 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sipa1P46062 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sipa1P46062 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sipa1P46062 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sipa1P46062 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sipa1P46062 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sipa1P46062 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sipa1P46062 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms