Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HttP42859 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HttP42859 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HttP42859 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HttP42859 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HttP42859 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HttP42859 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HttP42859 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HttP42859 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HttP42859 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HttP42859 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HttP42859 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HttP42859 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HttP42859 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HttP42859 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HttP42859 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HttP42859 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HttP42859 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HttP42859 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HttP42859 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HttP42859 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HttP42859 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HttP42859 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HttP42859 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HttP42859 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HttP42859 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HttP42859 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HttP42859 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HttP42859 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
HttP42859 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HttP42859 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HttP42859 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HttP42859 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HttP42859 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HttP42859 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HttP42859 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HttP42859 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HttP42859 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HttP42859 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HttP42859 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HttP42859 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HttP42859 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HttP42859 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HttP42859 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HttP42859 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HttP42859 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HttP42859 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HttP42859 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HttP42859 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HttP42859 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HttP42859 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HttP42859 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HttP42859 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HttP42859 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HttP42859 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HttP42859 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HttP42859 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
HttP42859 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HttP42859 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HttP42859 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HttP42859 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HttP42859 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HttP42859 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HttP42859 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HttP42859 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HttP42859 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HttP42859 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HttP42859 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HttP42859 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HttP42859 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HttP42859 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HttP42859 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HttP42859 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HttP42859 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HttP42859 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HttP42859 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HttP42859 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HttP42859 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HttP42859 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HttP42859 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HttP42859 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HttP42859 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HttP42859 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HttP42859 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HttP42859 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HttP42859 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HttP42859 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HttP42859 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HttP42859 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HttP42859 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HttP42859 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HttP42859 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HttP42859 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HttP42859 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HttP42859 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HttP42859 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HttP42859 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HttP42859 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HttP42859 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HttP42859 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms