Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Elk1P41969 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Elk1P41969 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Elk1P41969 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Elk1P41969 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Elk1P41969 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Elk1P41969 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Elk1P41969 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Elk1P41969 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Elk1P41969 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Elk1P41969 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Elk1P41969 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Elk1P41969 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Elk1P41969 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Elk1P41969 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Elk1P41969 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Elk1P41969 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Elk1P41969 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Elk1P41969 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Elk1P41969 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Elk1P41969 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Elk1P41969 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Elk1P41969 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Elk1P41969 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Elk1P41969 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elk1P41969 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Elk1P41969 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elk1P41969 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elk1P41969 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elk1P41969 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Elk1P41969 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Elk1P41969 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elk1P41969 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elk1P41969 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Elk1P41969 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Elk1P41969 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Elk1P41969 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elk1P41969 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Elk1P41969 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Elk1P41969 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elk1P41969 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elk1P41969 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Elk1P41969 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elk1P41969 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elk1P41969 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elk1P41969 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elk1P41969 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Elk1P41969 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Elk1P41969 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Elk1P41969 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Elk1P41969 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Elk1P41969 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Elk1P41969 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Elk1P41969 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Elk1P41969 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Elk1P41969 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms