Protein–RNA interactions for Protein: P40356

PGD1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 3, yeastyeast

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PGD1P40356 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.43□□□□□ -1.22
PGD1P40356 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.43□□□□□ -1.22
PGD1P40356 TRP2YER090W 1524 nt7.42□□□□□ -1.22
PGD1P40356 YER188WYER188W 720 nt7.42□□□□□ -1.22
PGD1P40356 YLR173WYLR173W 1827 nt7.42□□□□□ -1.22
PGD1P40356 OSH7YHR001W 1314 nt7.42□□□□□ -1.22
PGD1P40356 PFS2YNL317W 1398 nt7.41□□□□□ -1.22
PGD1P40356 HXT11YOL156W 1704 nt7.41□□□□□ -1.22
PGD1P40356 YIL177CYIL177C 5277 nt7.41□□□□□ -1.22
PGD1P40356 SFL1YOR140W 2301 nt7.4□□□□□ -1.22
PGD1P40356 YDR467CYDR467C 327 nt7.4□□□□□ -1.22
PGD1P40356 THI6YPL214C 1623 nt7.4□□□□□ -1.22
PGD1P40356 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.39□□□□□ -1.23
PGD1P40356 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.39□□□□□ -1.23
PGD1P40356 MIR1YJR077C 936 nt7.39□□□□□ -1.23
PGD1P40356 LAS17YOR181W 1902 nt7.37□□□□□ -1.23
PGD1P40356 FIT3YOR383C 615 nt7.37□□□□□ -1.23
PGD1P40356 PHO89YBR296C 1725 nt7.36□□□□□ -1.23
PGD1P40356 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.36□□□□□ -1.23
PGD1P40356 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.36□□□□□ -1.23
PGD1P40356 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.36□□□□□ -1.23
PGD1P40356 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.36□□□□□ -1.23
PGD1P40356 RTG2YGL252C 1767 nt7.36□□□□□ -1.23
PGD1P40356 HSV2YGR223C 1347 nt7.35□□□□□ -1.23
PGD1P40356 UBA4YHR111W 1323 nt7.35□□□□□ -1.23
PGD1P40356 FUB1YCR076C 753 nt7.35□□□□□ -1.23
PGD1P40356 TAT2YOL020W 1779 nt7.35□□□□□ -1.23
PGD1P40356 EMC3YKL207W 762 nt7.34□□□□□ -1.23
PGD1P40356 COQ2YNR041C 1119 nt7.34□□□□□ -1.23
PGD1P40356 SRM1YGL097W 1449 nt7.34□□□□□ -1.23
PGD1P40356 DIA4YHR011W 1341 nt7.33□□□□□ -1.24
PGD1P40356 BNI5YNL166C 1347 nt7.33□□□□□ -1.24
PGD1P40356 AIM34YMR003W 597 nt7.33□□□□□ -1.24
PGD1P40356 MSC1YML128C 1542 nt7.32□□□□□ -1.24
PGD1P40356 SLM3YDL033C 1254 nt7.32□□□□□ -1.24
PGD1P40356 GPN2YOR262W 1044 nt7.32□□□□□ -1.24
PGD1P40356 MDH2YOL126C 1134 nt7.31□□□□□ -1.24
PGD1P40356 GND1YHR183W 1470 nt7.3□□□□□ -1.24
PGD1P40356 SOL2YCR073W-A 948 nt7.29□□□□□ -1.24
PGD1P40356 FTH1YBR207W 1398 nt7.29□□□□□ -1.24
PGD1P40356 RRT5YFR032C 870 nt7.28□□□□□ -1.24
PGD1P40356 YMR210WYMR210W 1350 nt7.28□□□□□ -1.24
PGD1P40356 YSR3YKR053C 1215 nt7.27□□□□□ -1.25
PGD1P40356 YBL095WYBL095W 813 nt7.27□□□□□ -1.25
PGD1P40356 ITR1YDR497C 1755 nt7.26□□□□□ -1.25
PGD1P40356 AAT1YKL106W 1356 nt7.26□□□□□ -1.25
PGD1P40356 THI74YDR438W 1113 nt7.26□□□□□ -1.25
PGD1P40356 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.26□□□□□ -1.25
PGD1P40356 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.26□□□□□ -1.25
PGD1P40356 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.26□□□□□ -1.25
PGD1P40356 NAT4YMR069W 858 nt7.25□□□□□ -1.25
PGD1P40356 GCD11YER025W 1584 nt7.25□□□□□ -1.25
PGD1P40356 YCR087WYCR087W 516 nt7.24□□□□□ -1.25
PGD1P40356 YDR094WYDR094W 336 nt7.24□□□□□ -1.25
PGD1P40356 RAS2YNL098C 969 nt7.24□□□□□ -1.25
PGD1P40356 FRT1YOR324C 1809 nt7.24□□□□□ -1.25
PGD1P40356 YMR265CYMR265C 1386 nt7.23□□□□□ -1.25
PGD1P40356 CHA1YCL064C 1083 nt7.23□□□□□ -1.25
PGD1P40356 GGC1YDL198C 903 nt7.23□□□□□ -1.25
PGD1P40356 CLB6YGR109C 1143 nt7.23□□□□□ -1.25
PGD1P40356 ATP10YLR393W 840 nt7.23□□□□□ -1.25
PGD1P40356 PRC1YMR297W 1599 nt7.22□□□□□ -1.25
PGD1P40356 RPL4BYDR012W 1089 nt7.22□□□□□ -1.25
PGD1P40356 PAU16YKL224C 372 nt7.22□□□□□ -1.25
PGD1P40356 XYL2YLR070C 1071 nt7.22□□□□□ -1.25
PGD1P40356 RPL4AYBR031W 1089 nt7.22□□□□□ -1.25
PGD1P40356 TOP3YLR234W 1971 nt7.21□□□□□ -1.26
PGD1P40356 RPN14YGL004C 1254 nt7.21□□□□□ -1.26
PGD1P40356 GPM1YKL152C 744 nt7.21□□□□□ -1.26
PGD1P40356 YMC2YBR104W 990 nt7.21□□□□□ -1.26
PGD1P40356 MAS1YLR163C 1389 nt7.2□□□□□ -1.26
PGD1P40356 GNP1YDR508C 1992 nt7.2□□□□□ -1.26
PGD1P40356 YDR455CYDR455C 309 nt7.2□□□□□ -1.26
PGD1P40356 RPS14BYJL191W 417 nt7.2□□□□□ -1.26
PGD1P40356 LOT5YKL183W 921 nt7.2□□□□□ -1.26
PGD1P40356 ADE2YOR128C 1716 nt7.18□□□□□ -1.26
PGD1P40356 SPE4YLR146C 903 nt7.18□□□□□ -1.26
PGD1P40356 HAP5YOR358W 729 nt7.18□□□□□ -1.26
PGD1P40356 AIM45YPR004C 1035 nt7.18□□□□□ -1.26
PGD1P40356 PMT7YDR307W 1989 nt7.18□□□□□ -1.26
PGD1P40356 SNU66YOR308C 1764 nt7.18□□□□□ -1.26
PGD1P40356 ERG13YML126C 1476 nt7.17□□□□□ -1.26
PGD1P40356 SAC7YDR389W 1965 nt7.17□□□□□ -1.26
PGD1P40356 BEM1YBR200W 1656 nt7.17□□□□□ -1.26
PGD1P40356 APT2YDR441C 546 nt7.17□□□□□ -1.26
PGD1P40356 NUC1YJL208C 990 nt7.17□□□□□ -1.26
PGD1P40356 ERG6YML008C 1152 nt7.17□□□□□ -1.26
PGD1P40356 CTF3YLR381W 2202 nt7.17□□□□□ -1.26
PGD1P40356 YLR072WYLR072W 2082 nt7.16□□□□□ -1.26
PGD1P40356 LEA1YPL213W 717 nt7.16□□□□□ -1.26
PGD1P40356 YPL264CYPL264C 1062 nt7.16□□□□□ -1.26
PGD1P40356 PMA2YPL036W 2844 nt7.16□□□□□ -1.26
PGD1P40356 YGL034CYGL034C 366 nt7.15□□□□□ -1.26
PGD1P40356 ELO1YJL196C 933 nt7.15□□□□□ -1.26
PGD1P40356 ERR3YMR323W 1314 nt7.13□□□□□ -1.27
PGD1P40356 ERR1YOR393W 1314 nt7.13□□□□□ -1.27
PGD1P40356 ERR2YPL281C 1314 nt7.13□□□□□ -1.27
PGD1P40356 MAM3YOL060C 2121 nt7.13□□□□□ -1.27
PGD1P40356 ECM10YEL030W 1935 nt7.13□□□□□ -1.27
PGD1P40356 NDE1YMR145C 1683 nt7.12□□□□□ -1.27
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