Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cd9P40240 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd9P40240 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd9P40240 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd9P40240 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cd9P40240 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd9P40240 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd9P40240 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd9P40240 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd9P40240 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd9P40240 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd9P40240 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd9P40240 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd9P40240 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd9P40240 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd9P40240 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd9P40240 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cd9P40240 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd9P40240 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd9P40240 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd9P40240 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd9P40240 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd9P40240 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd9P40240 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd9P40240 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd9P40240 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cd9P40240 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cd9P40240 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd9P40240 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd9P40240 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd9P40240 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd9P40240 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd9P40240 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cd9P40240 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd9P40240 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd9P40240 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd9P40240 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd9P40240 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd9P40240 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cd9P40240 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd9P40240 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd9P40240 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd9P40240 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd9P40240 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd9P40240 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd9P40240 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd9P40240 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd9P40240 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd9P40240 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd9P40240 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd9P40240 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cd9P40240 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cd9P40240 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd9P40240 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd9P40240 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd9P40240 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd9P40240 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd9P40240 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd9P40240 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd9P40240 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd9P40240 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd9P40240 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd9P40240 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd9P40240 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd9P40240 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd9P40240 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd9P40240 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd9P40240 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cd9P40240 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd9P40240 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cd9P40240 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd9P40240 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd9P40240 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd9P40240 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd9P40240 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd9P40240 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd9P40240 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd9P40240 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cd9P40240 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cd9P40240 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd9P40240 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd9P40240 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cd9P40240 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd9P40240 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cd9P40240 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd9P40240 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cd9P40240 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cd9P40240 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd9P40240 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd9P40240 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd9P40240 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd9P40240 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cd9P40240 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd9P40240 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd9P40240 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd9P40240 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd9P40240 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cd9P40240 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd9P40240 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd9P40240 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms