Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 PCP1YGR101W 1041 nt11.52□□□□□ -0.56
YRF1-2P40105 SPE2YOL052C 1191 nt11.52□□□□□ -0.56
YRF1-2P40105 LSM5YER146W 282 nt11.52□□□□□ -0.57
YRF1-2P40105 PET8YNL003C 855 nt11.51□□□□□ -0.57
YRF1-2P40105 TOS1YBR162C 1368 nt11.51□□□□□ -0.57
YRF1-2P40105 ADE8YDR408C 645 nt11.5□□□□□ -0.57
YRF1-2P40105 YPS3YLR121C 1527 nt11.49□□□□□ -0.57
YRF1-2P40105 SPS100YHR139C 981 nt11.49□□□□□ -0.57
YRF1-2P40105 THP3YPR045C 1413 nt11.48□□□□□ -0.57
YRF1-2P40105 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt11.48□□□□□ -0.57
YRF1-2P40105 ABZ2YMR289W 1125 nt11.48□□□□□ -0.57
YRF1-2P40105 PHB2YGR231C 933 nt11.47□□□□□ -0.57
YRF1-2P40105 KAE1YKR038C 1161 nt11.47□□□□□ -0.57
YRF1-2P40105 OSH7YHR001W 1314 nt11.47□□□□□ -0.57
YRF1-2P40105 DLD2YDL178W 1593 nt11.47□□□□□ -0.57
YRF1-2P40105 YJL067WYJL067W 351 nt11.46□□□□□ -0.57
YRF1-2P40105 SPP2YOR148C 558 nt11.46□□□□□ -0.58
YRF1-2P40105 EDC2YER035W 438 nt11.44□□□□□ -0.58
YRF1-2P40105 OXA1YER154W 1209 nt11.43□□□□□ -0.58
YRF1-2P40105 ADH3YMR083W 1128 nt11.43□□□□□ -0.58
YRF1-2P40105 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt11.43□□□□□ -0.58
YRF1-2P40105 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt11.43□□□□□ -0.58
YRF1-2P40105 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt11.43□□□□□ -0.58
YRF1-2P40105 SUP51tL(UAA)J 84 nt11.43□□□□□ -0.58
YRF1-2P40105 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt11.43□□□□□ -0.58
YRF1-2P40105 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt11.43□□□□□ -0.58
YRF1-2P40105 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt11.43□□□□□ -0.58
YRF1-2P40105 HTS1YPR033C 1641 nt11.43□□□□□ -0.58
YRF1-2P40105 SER2YGR208W 930 nt11.42□□□□□ -0.58
YRF1-2P40105 NAR1YNL240C 1476 nt11.41□□□□□ -0.58
YRF1-2P40105 ZRT3YKL175W 1512 nt11.4□□□□□ -0.58
YRF1-2P40105 FMS1YMR020W 1527 nt11.4□□□□□ -0.58
YRF1-2P40105 HEM13YDR044W 987 nt11.4□□□□□ -0.59
YRF1-2P40105 SOL2YCR073W-A 948 nt11.39□□□□□ -0.59
YRF1-2P40105 MOB1YIL106W 945 nt11.39□□□□□ -0.59
YRF1-2P40105 TAT2YOL020W 1779 nt11.38□□□□□ -0.59
YRF1-2P40105 YDR455CYDR455C 309 nt11.38□□□□□ -0.59
YRF1-2P40105 HRA1HRA1 564 nt11.38□□□□□ -0.59
YRF1-2P40105 MCH5YOR306C 1566 nt11.38□□□□□ -0.59
YRF1-2P40105 CWC15YDR163W 528 nt11.36□□□□□ -0.59
YRF1-2P40105 IMO32YGR031W 1029 nt11.36□□□□□ -0.59
YRF1-2P40105 SRP102YKL154W 735 nt11.36□□□□□ -0.59
YRF1-2P40105 ALG12YNR030W 1656 nt11.34□□□□□ -0.59
YRF1-2P40105 PRE5YMR314W 705 nt11.33□□□□□ -0.6
YRF1-2P40105 BET2YPR176C 978 nt11.33□□□□□ -0.6
YRF1-2P40105 EMC3YKL207W 762 nt11.32□□□□□ -0.6
YRF1-2P40105 ELP4YPL101W 1371 nt11.31□□□□□ -0.6
YRF1-2P40105 SDH8YBR269C 417 nt11.3□□□□□ -0.6
YRF1-2P40105 ERG13YML126C 1476 nt11.29□□□□□ -0.6
YRF1-2P40105 BAP3YDR046C 1815 nt11.29□□□□□ -0.6
YRF1-2P40105 PBP1YGR178C 2169 nt11.29□□□□□ -0.6
YRF1-2P40105 YAT1YAR035W 2064 nt11.28□□□□□ -0.6
YRF1-2P40105 YPL247CYPL247C 1572 nt11.27□□□□□ -0.61
YRF1-2P40105 FSH2YMR222C 672 nt11.24□□□□□ -0.61
YRF1-2P40105 ENO2YHR174W 1314 nt11.24□□□□□ -0.61
YRF1-2P40105 ERO1YML130C 1692 nt11.23□□□□□ -0.61
YRF1-2P40105 ACH1YBL015W 1581 nt11.23□□□□□ -0.61
YRF1-2P40105 CYC3YAL039C 810 nt11.21□□□□□ -0.61
YRF1-2P40105 AIM1YAL046C 357 nt11.21□□□□□ -0.61
YRF1-2P40105 YJL160CYJL160C 864 nt11.2□□□□□ -0.62
YRF1-2P40105 DIG1YPL049C 1359 nt11.2□□□□□ -0.62
YRF1-2P40105 YMR210WYMR210W 1350 nt11.19□□□□□ -0.62
YRF1-2P40105 ASP3-1YLR155C 1089 nt11.19□□□□□ -0.62
YRF1-2P40105 ASP3-2YLR157C 1089 nt11.19□□□□□ -0.62
YRF1-2P40105 ASP3-3YLR158C 1089 nt11.19□□□□□ -0.62
YRF1-2P40105 ASP3-4YLR160C 1089 nt11.19□□□□□ -0.62
YRF1-2P40105 PET18YCR020C 648 nt11.18□□□□□ -0.62
YRF1-2P40105 OPI3YJR073C 621 nt11.17□□□□□ -0.62
YRF1-2P40105 YNR064CYNR064C 873 nt11.16□□□□□ -0.62
YRF1-2P40105 SDS24YBR214W 1584 nt11.15□□□□□ -0.62
YRF1-2P40105 REX2YLR059C 810 nt11.15□□□□□ -0.62
YRF1-2P40105 CYT2YKL087C 675 nt11.14□□□□□ -0.63
YRF1-2P40105 YGR210CYGR210C 1236 nt11.12□□□□□ -0.63
YRF1-2P40105 TPC1YGR096W 945 nt11.11□□□□□ -0.63
YRF1-2P40105 ADA2YDR448W 1305 nt11.1□□□□□ -0.63
YRF1-2P40105 TVP23YDR084C 600 nt11.1□□□□□ -0.63
YRF1-2P40105 VPS62YGR141W 1404 nt11.09□□□□□ -0.63
YRF1-2P40105 UTR5YEL035C 501 nt11.09□□□□□ -0.63
YRF1-2P40105 NAM8YHR086W 1572 nt11.09□□□□□ -0.63
YRF1-2P40105 RRT8YOL048C 1029 nt11.08□□□□□ -0.64
YRF1-2P40105 ELO1YJL196C 933 nt11.08□□□□□ -0.64
YRF1-2P40105 ENO1YGR254W 1314 nt11.07□□□□□ -0.64
YRF1-2P40105 YKR012CYKR012C 378 nt11.07□□□□□ -0.64
YRF1-2P40105 YPL108WYPL108W 507 nt11.07□□□□□ -0.64
YRF1-2P40105 MRP1YDR347W 966 nt11.05□□□□□ -0.64
YRF1-2P40105 YLR280CYLR280C 351 nt11.05□□□□□ -0.64
YRF1-2P40105 SAC7YDR389W 1965 nt11.04□□□□□ -0.64
YRF1-2P40105 AMF1YOR378W 1548 nt11.02□□□□□ -0.64
YRF1-2P40105 OPI10YOL032W 741 nt11.01□□□□□ -0.65
YRF1-2P40105 CCT2YIL142W 1584 nt11.01□□□□□ -0.65
YRF1-2P40105 YDL086WYDL086W 822 nt11.01□□□□□ -0.65
YRF1-2P40105 ADE1YAR015W 921 nt10.98□□□□□ -0.65
YRF1-2P40105 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.98□□□□□ -0.65
YRF1-2P40105 YLR046CYLR046C 813 nt10.96□□□□□ -0.65
YRF1-2P40105 FUS3YBL016W 1062 nt10.96□□□□□ -0.65
YRF1-2P40105 YOR325WYOR325W 474 nt10.96□□□□□ -0.65
YRF1-2P40105 UME6YDR207C 2511 nt10.95□□□□□ -0.66
YRF1-2P40105 LEU2YCL018W 1095 nt10.94□□□□□ -0.66
YRF1-2P40105 YMR166CYMR166C 1107 nt10.92□□□□□ -0.66
YRF1-2P40105 VBA3YCL069W 1377 nt10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.9 ms