Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Upk2P38575 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Upk2P38575 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Upk2P38575 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Upk2P38575 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Upk2P38575 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Upk2P38575 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Upk2P38575 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Upk2P38575 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Upk2P38575 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Upk2P38575 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upk2P38575 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upk2P38575 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Upk2P38575 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Upk2P38575 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Upk2P38575 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Upk2P38575 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upk2P38575 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Upk2P38575 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Upk2P38575 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Upk2P38575 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Upk2P38575 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upk2P38575 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upk2P38575 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Upk2P38575 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Upk2P38575 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Upk2P38575 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Upk2P38575 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Upk2P38575 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upk2P38575 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Upk2P38575 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Upk2P38575 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upk2P38575 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upk2P38575 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upk2P38575 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upk2P38575 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upk2P38575 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Upk2P38575 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Upk2P38575 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Upk2P38575 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Upk2P38575 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Upk2P38575 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Upk2P38575 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Upk2P38575 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Upk2P38575 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Upk2P38575 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Upk2P38575 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Upk2P38575 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Upk2P38575 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Upk2P38575 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Upk2P38575 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.29■■□□□ 1
Upk2P38575 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Upk2P38575 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Upk2P38575 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Upk2P38575 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Upk2P38575 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Upk2P38575 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Upk2P38575 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Upk2P38575 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Upk2P38575 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Upk2P38575 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Upk2P38575 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Upk2P38575 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Upk2P38575 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Upk2P38575 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Upk2P38575 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Upk2P38575 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upk2P38575 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upk2P38575 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Upk2P38575 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Upk2P38575 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Upk2P38575 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Upk2P38575 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Upk2P38575 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Upk2P38575 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Upk2P38575 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upk2P38575 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upk2P38575 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Upk2P38575 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Upk2P38575 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Upk2P38575 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Upk2P38575 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upk2P38575 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upk2P38575 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Upk2P38575 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upk2P38575 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upk2P38575 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upk2P38575 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upk2P38575 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upk2P38575 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upk2P38575 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upk2P38575 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upk2P38575 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upk2P38575 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upk2P38575 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upk2P38575 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Upk2P38575 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Upk2P38575 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upk2P38575 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upk2P38575 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms