Protein–RNA interactions for Protein: P35846

Folr1, Folate receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr1P35846 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Folr1P35846 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Folr1P35846 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Folr1P35846 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Folr1P35846 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Folr1P35846 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Folr1P35846 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Folr1P35846 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Folr1P35846 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Folr1P35846 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Folr1P35846 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Folr1P35846 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Folr1P35846 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Folr1P35846 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Folr1P35846 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Folr1P35846 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Folr1P35846 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Folr1P35846 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Folr1P35846 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Folr1P35846 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Folr1P35846 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Folr1P35846 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Folr1P35846 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Folr1P35846 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Folr1P35846 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Folr1P35846 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Folr1P35846 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Folr1P35846 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Folr1P35846 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Folr1P35846 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Folr1P35846 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Folr1P35846 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Folr1P35846 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Folr1P35846 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Folr1P35846 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Folr1P35846 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Folr1P35846 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Folr1P35846 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Folr1P35846 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Folr1P35846 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Folr1P35846 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Folr1P35846 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Folr1P35846 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Folr1P35846 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Folr1P35846 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Folr1P35846 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Folr1P35846 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Folr1P35846 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Folr1P35846 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Folr1P35846 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Folr1P35846 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Folr1P35846 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Folr1P35846 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Folr1P35846 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Folr1P35846 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Folr1P35846 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Folr1P35846 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Folr1P35846 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Folr1P35846 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Folr1P35846 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Folr1P35846 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Folr1P35846 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Folr1P35846 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Folr1P35846 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Folr1P35846 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Folr1P35846 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Folr1P35846 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Folr1P35846 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Folr1P35846 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Folr1P35846 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Folr1P35846 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Folr1P35846 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Folr1P35846 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Folr1P35846 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Folr1P35846 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Folr1P35846 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Folr1P35846 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Folr1P35846 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Folr1P35846 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Folr1P35846 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Folr1P35846 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Folr1P35846 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Folr1P35846 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Folr1P35846 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Folr1P35846 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Folr1P35846 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Folr1P35846 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Folr1P35846 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Folr1P35846 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Folr1P35846 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Folr1P35846 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Folr1P35846 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Folr1P35846 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Folr1P35846 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Folr1P35846 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Folr1P35846 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Folr1P35846 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Folr1P35846 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Folr1P35846 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Folr1P35846 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms