Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BrafP28028 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BrafP28028 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BrafP28028 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BrafP28028 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BrafP28028 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BrafP28028 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BrafP28028 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BrafP28028 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BrafP28028 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BrafP28028 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BrafP28028 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BrafP28028 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BrafP28028 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BrafP28028 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BrafP28028 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BrafP28028 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BrafP28028 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BrafP28028 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BrafP28028 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BrafP28028 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BrafP28028 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BrafP28028 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BrafP28028 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BrafP28028 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BrafP28028 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BrafP28028 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BrafP28028 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BrafP28028 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BrafP28028 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BrafP28028 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BrafP28028 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BrafP28028 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BrafP28028 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BrafP28028 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BrafP28028 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BrafP28028 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BrafP28028 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BrafP28028 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BrafP28028 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BrafP28028 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BrafP28028 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BrafP28028 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BrafP28028 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BrafP28028 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BrafP28028 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BrafP28028 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BrafP28028 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BrafP28028 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BrafP28028 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BrafP28028 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BrafP28028 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BrafP28028 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BrafP28028 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BrafP28028 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BrafP28028 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BrafP28028 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BrafP28028 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BrafP28028 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BrafP28028 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BrafP28028 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BrafP28028 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BrafP28028 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BrafP28028 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BrafP28028 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BrafP28028 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BrafP28028 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BrafP28028 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BrafP28028 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BrafP28028 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BrafP28028 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BrafP28028 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BrafP28028 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BrafP28028 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BrafP28028 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BrafP28028 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BrafP28028 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BrafP28028 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BrafP28028 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BrafP28028 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BrafP28028 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BrafP28028 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BrafP28028 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BrafP28028 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BrafP28028 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BrafP28028 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BrafP28028 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BrafP28028 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BrafP28028 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BrafP28028 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BrafP28028 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BrafP28028 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BrafP28028 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BrafP28028 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BrafP28028 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BrafP28028 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BrafP28028 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BrafP28028 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BrafP28028 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BrafP28028 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms