Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bmi1P25916 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bmi1P25916 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bmi1P25916 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bmi1P25916 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bmi1P25916 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bmi1P25916 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bmi1P25916 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bmi1P25916 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bmi1P25916 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Bmi1P25916 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bmi1P25916 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Bmi1P25916 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bmi1P25916 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bmi1P25916 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bmi1P25916 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bmi1P25916 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bmi1P25916 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bmi1P25916 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bmi1P25916 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bmi1P25916 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Bmi1P25916 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bmi1P25916 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bmi1P25916 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Bmi1P25916 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bmi1P25916 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bmi1P25916 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Bmi1P25916 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bmi1P25916 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bmi1P25916 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.32■■□□□ 1
Bmi1P25916 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bmi1P25916 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bmi1P25916 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bmi1P25916 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bmi1P25916 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Bmi1P25916 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bmi1P25916 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bmi1P25916 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bmi1P25916 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Bmi1P25916 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Bmi1P25916 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Bmi1P25916 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bmi1P25916 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bmi1P25916 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bmi1P25916 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bmi1P25916 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bmi1P25916 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bmi1P25916 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bmi1P25916 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bmi1P25916 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bmi1P25916 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bmi1P25916 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bmi1P25916 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bmi1P25916 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bmi1P25916 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bmi1P25916 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bmi1P25916 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bmi1P25916 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Bmi1P25916 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Bmi1P25916 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Bmi1P25916 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Bmi1P25916 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bmi1P25916 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Bmi1P25916 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Bmi1P25916 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmi1P25916 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmi1P25916 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Bmi1P25916 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Bmi1P25916 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmi1P25916 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmi1P25916 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Bmi1P25916 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bmi1P25916 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Bmi1P25916 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bmi1P25916 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bmi1P25916 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Bmi1P25916 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Bmi1P25916 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmi1P25916 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmi1P25916 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Bmi1P25916 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms