Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

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Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HdcP23738 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HdcP23738 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HdcP23738 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HdcP23738 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HdcP23738 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HdcP23738 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HdcP23738 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HdcP23738 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HdcP23738 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HdcP23738 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HdcP23738 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HdcP23738 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HdcP23738 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HdcP23738 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HdcP23738 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HdcP23738 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
HdcP23738 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HdcP23738 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HdcP23738 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HdcP23738 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HdcP23738 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HdcP23738 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HdcP23738 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HdcP23738 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HdcP23738 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HdcP23738 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HdcP23738 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HdcP23738 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HdcP23738 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HdcP23738 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HdcP23738 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HdcP23738 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HdcP23738 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HdcP23738 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HdcP23738 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HdcP23738 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HdcP23738 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HdcP23738 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HdcP23738 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HdcP23738 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HdcP23738 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HdcP23738 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HdcP23738 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HdcP23738 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HdcP23738 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HdcP23738 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HdcP23738 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HdcP23738 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HdcP23738 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HdcP23738 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HdcP23738 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HdcP23738 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HdcP23738 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HdcP23738 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HdcP23738 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
HdcP23738 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HdcP23738 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HdcP23738 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HdcP23738 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HdcP23738 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HdcP23738 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HdcP23738 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HdcP23738 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HdcP23738 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HdcP23738 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HdcP23738 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HdcP23738 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HdcP23738 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HdcP23738 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HdcP23738 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HdcP23738 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HdcP23738 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HdcP23738 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HdcP23738 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HdcP23738 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HdcP23738 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HdcP23738 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HdcP23738 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HdcP23738 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HdcP23738 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HdcP23738 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HdcP23738 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HdcP23738 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HdcP23738 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HdcP23738 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HdcP23738 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HdcP23738 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HdcP23738 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HdcP23738 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HdcP23738 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HdcP23738 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HdcP23738 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HdcP23738 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HdcP23738 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HdcP23738 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HdcP23738 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HdcP23738 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HdcP23738 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HdcP23738 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms