Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P20040 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P20040 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P20040 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
P20040 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P20040 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P20040 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
P20040 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P20040 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P20040 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.28■■□□□ 1
P20040 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P20040 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P20040 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P20040 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P20040 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P20040 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P20040 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P20040 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P20040 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P20040 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P20040 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P20040 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
P20040 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P20040 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P20040 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P20040 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P20040 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P20040 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P20040 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P20040 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P20040 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P20040 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P20040 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P20040 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P20040 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P20040 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P20040 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P20040 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
P20040 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P20040 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P20040 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P20040 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P20040 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P20040 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P20040 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P20040 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P20040 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P20040 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P20040 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P20040 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
P20040 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
P20040 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P20040 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
P20040 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P20040 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P20040 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P20040 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P20040 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P20040 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P20040 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P20040 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P20040 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P20040 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P20040 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P20040 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P20040 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P20040 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P20040 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P20040 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P20040 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P20040 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P20040 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P20040 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P20040 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
P20040 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P20040 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
P20040 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
P20040 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P20040 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
P20040 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P20040 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P20040 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P20040 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P20040 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P20040 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
P20040 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
P20040 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
P20040 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P20040 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P20040 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P20040 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P20040 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P20040 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
P20040 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P20040 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P20040 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P20040 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P20040 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
P20040 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
P20040 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms