Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtpraP18052 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtpraP18052 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtpraP18052 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtpraP18052 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtpraP18052 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtpraP18052 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtpraP18052 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtpraP18052 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtpraP18052 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtpraP18052 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtpraP18052 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtpraP18052 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtpraP18052 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtpraP18052 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtpraP18052 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PtpraP18052 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtpraP18052 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtpraP18052 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtpraP18052 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtpraP18052 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtpraP18052 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtpraP18052 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtpraP18052 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtpraP18052 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtpraP18052 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtpraP18052 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtpraP18052 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PtpraP18052 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtpraP18052 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PtpraP18052 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PtpraP18052 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtpraP18052 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PtpraP18052 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtpraP18052 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtpraP18052 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtpraP18052 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtpraP18052 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtpraP18052 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PtpraP18052 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PtpraP18052 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PtpraP18052 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtpraP18052 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtpraP18052 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtpraP18052 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtpraP18052 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtpraP18052 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtpraP18052 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtpraP18052 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtpraP18052 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtpraP18052 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtpraP18052 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtpraP18052 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtpraP18052 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtpraP18052 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtpraP18052 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtpraP18052 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PtpraP18052 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtpraP18052 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtpraP18052 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtpraP18052 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtpraP18052 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtpraP18052 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtpraP18052 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtpraP18052 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PtpraP18052 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtpraP18052 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PtpraP18052 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtpraP18052 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtpraP18052 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtpraP18052 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtpraP18052 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtpraP18052 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtpraP18052 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PtpraP18052 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PtpraP18052 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtpraP18052 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtpraP18052 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtpraP18052 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PtpraP18052 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PtpraP18052 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PtpraP18052 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PtpraP18052 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtpraP18052 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PtpraP18052 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PtpraP18052 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtpraP18052 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtpraP18052 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PtpraP18052 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtpraP18052 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PtpraP18052 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtpraP18052 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PtpraP18052 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PtpraP18052 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtpraP18052 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PtpraP18052 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtpraP18052 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PtpraP18052 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PtpraP18052 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PtpraP18052 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
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