Protein–RNA interactions for Protein: P16294

F9, Coagulation factor IX, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P16294 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
F9P16294 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F9P16294 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F9P16294 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
F9P16294 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F9P16294 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F9P16294 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
F9P16294 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F9P16294 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
F9P16294 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F9P16294 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F9P16294 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
F9P16294 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F9P16294 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F9P16294 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F9P16294 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F9P16294 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F9P16294 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
F9P16294 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
F9P16294 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F9P16294 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F9P16294 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
F9P16294 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
F9P16294 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F9P16294 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
F9P16294 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
F9P16294 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
F9P16294 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
F9P16294 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
F9P16294 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F9P16294 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F9P16294 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F9P16294 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F9P16294 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
F9P16294 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
F9P16294 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F9P16294 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F9P16294 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F9P16294 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F9P16294 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
F9P16294 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
F9P16294 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
F9P16294 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
F9P16294 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
F9P16294 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
F9P16294 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F9P16294 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
F9P16294 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F9P16294 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
F9P16294 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
F9P16294 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
F9P16294 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
F9P16294 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
F9P16294 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
F9P16294 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
F9P16294 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
F9P16294 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
F9P16294 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
F9P16294 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
F9P16294 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
F9P16294 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
F9P16294 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
F9P16294 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
F9P16294 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
F9P16294 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
F9P16294 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F9P16294 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F9P16294 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F9P16294 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F9P16294 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
F9P16294 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F9P16294 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
F9P16294 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F9P16294 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F9P16294 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
F9P16294 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F9P16294 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
F9P16294 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
F9P16294 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
F9P16294 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
F9P16294 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
F9P16294 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
F9P16294 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
F9P16294 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
F9P16294 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
F9P16294 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
F9P16294 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
F9P16294 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
F9P16294 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
F9P16294 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
F9P16294 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
F9P16294 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
F9P16294 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
F9P16294 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
F9P16294 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
F9P16294 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
F9P16294 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
F9P16294 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
F9P16294 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
F9P16294 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms