Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Msh3P13705 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Msh3P13705 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Msh3P13705 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Msh3P13705 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Msh3P13705 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Msh3P13705 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Msh3P13705 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Msh3P13705 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Msh3P13705 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Msh3P13705 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Msh3P13705 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Msh3P13705 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Msh3P13705 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Msh3P13705 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Msh3P13705 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Msh3P13705 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Msh3P13705 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Msh3P13705 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Msh3P13705 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Msh3P13705 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Msh3P13705 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Msh3P13705 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Msh3P13705 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Msh3P13705 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Msh3P13705 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Msh3P13705 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Msh3P13705 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Msh3P13705 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Msh3P13705 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Msh3P13705 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Msh3P13705 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Msh3P13705 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Msh3P13705 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Msh3P13705 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Msh3P13705 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Msh3P13705 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Msh3P13705 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Msh3P13705 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Msh3P13705 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Msh3P13705 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Msh3P13705 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Msh3P13705 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Msh3P13705 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Msh3P13705 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Msh3P13705 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Msh3P13705 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Msh3P13705 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Msh3P13705 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Msh3P13705 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Msh3P13705 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Msh3P13705 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Msh3P13705 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Msh3P13705 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Msh3P13705 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Msh3P13705 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Msh3P13705 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Msh3P13705 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Msh3P13705 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Msh3P13705 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Msh3P13705 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Msh3P13705 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Msh3P13705 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Msh3P13705 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Msh3P13705 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Msh3P13705 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Msh3P13705 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Msh3P13705 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Msh3P13705 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Msh3P13705 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Msh3P13705 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Msh3P13705 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Msh3P13705 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Msh3P13705 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Msh3P13705 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Msh3P13705 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Msh3P13705 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Msh3P13705 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Msh3P13705 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Msh3P13705 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Msh3P13705 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Msh3P13705 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Msh3P13705 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Msh3P13705 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Msh3P13705 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Msh3P13705 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Msh3P13705 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Msh3P13705 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Msh3P13705 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Msh3P13705 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Msh3P13705 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Msh3P13705 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Msh3P13705 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Msh3P13705 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Msh3P13705 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Msh3P13705 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Msh3P13705 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Msh3P13705 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Msh3P13705 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Msh3P13705 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms