Protein–RNA interactions for Protein: P12961

Scg5, Neuroendocrine protein 7B2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg5P12961 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Scg5P12961 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scg5P12961 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scg5P12961 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scg5P12961 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scg5P12961 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scg5P12961 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scg5P12961 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scg5P12961 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scg5P12961 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scg5P12961 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scg5P12961 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scg5P12961 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scg5P12961 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scg5P12961 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scg5P12961 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scg5P12961 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scg5P12961 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scg5P12961 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scg5P12961 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Scg5P12961 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Scg5P12961 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scg5P12961 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scg5P12961 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scg5P12961 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scg5P12961 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Scg5P12961 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scg5P12961 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scg5P12961 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scg5P12961 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scg5P12961 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scg5P12961 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scg5P12961 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Scg5P12961 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scg5P12961 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scg5P12961 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scg5P12961 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scg5P12961 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scg5P12961 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scg5P12961 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scg5P12961 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scg5P12961 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Scg5P12961 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scg5P12961 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scg5P12961 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scg5P12961 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scg5P12961 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scg5P12961 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scg5P12961 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Scg5P12961 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scg5P12961 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scg5P12961 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Scg5P12961 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scg5P12961 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scg5P12961 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scg5P12961 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scg5P12961 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scg5P12961 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scg5P12961 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scg5P12961 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scg5P12961 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scg5P12961 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scg5P12961 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scg5P12961 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scg5P12961 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scg5P12961 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scg5P12961 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Scg5P12961 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scg5P12961 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scg5P12961 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scg5P12961 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scg5P12961 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scg5P12961 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scg5P12961 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scg5P12961 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scg5P12961 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scg5P12961 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scg5P12961 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scg5P12961 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scg5P12961 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Scg5P12961 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scg5P12961 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scg5P12961 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scg5P12961 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scg5P12961 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scg5P12961 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scg5P12961 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scg5P12961 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scg5P12961 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scg5P12961 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Scg5P12961 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scg5P12961 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scg5P12961 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scg5P12961 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Scg5P12961 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scg5P12961 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scg5P12961 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Scg5P12961 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Scg5P12961 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Scg5P12961 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms