Protein–RNA interactions for Protein: P11859

Agt, Angiotensinogen, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgtP11859 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AgtP11859 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
AgtP11859 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AgtP11859 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AgtP11859 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AgtP11859 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AgtP11859 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AgtP11859 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AgtP11859 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AgtP11859 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AgtP11859 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AgtP11859 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AgtP11859 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AgtP11859 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AgtP11859 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AgtP11859 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AgtP11859 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AgtP11859 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AgtP11859 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AgtP11859 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AgtP11859 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AgtP11859 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AgtP11859 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AgtP11859 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AgtP11859 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AgtP11859 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AgtP11859 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AgtP11859 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AgtP11859 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AgtP11859 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AgtP11859 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AgtP11859 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
AgtP11859 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AgtP11859 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AgtP11859 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AgtP11859 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AgtP11859 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AgtP11859 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AgtP11859 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AgtP11859 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
AgtP11859 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
AgtP11859 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AgtP11859 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AgtP11859 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AgtP11859 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AgtP11859 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AgtP11859 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AgtP11859 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AgtP11859 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AgtP11859 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AgtP11859 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AgtP11859 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AgtP11859 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AgtP11859 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
AgtP11859 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
AgtP11859 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AgtP11859 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AgtP11859 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AgtP11859 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AgtP11859 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AgtP11859 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AgtP11859 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AgtP11859 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AgtP11859 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
AgtP11859 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AgtP11859 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AgtP11859 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AgtP11859 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
AgtP11859 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AgtP11859 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AgtP11859 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AgtP11859 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AgtP11859 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AgtP11859 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AgtP11859 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
AgtP11859 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AgtP11859 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AgtP11859 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AgtP11859 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AgtP11859 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AgtP11859 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AgtP11859 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AgtP11859 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AgtP11859 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AgtP11859 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AgtP11859 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AgtP11859 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AgtP11859 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AgtP11859 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AgtP11859 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AgtP11859 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AgtP11859 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AgtP11859 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AgtP11859 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AgtP11859 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AgtP11859 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AgtP11859 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AgtP11859 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AgtP11859 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AgtP11859 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.9 ms