Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga5P11688 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga5P11688 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itga5P11688 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga5P11688 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itga5P11688 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga5P11688 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga5P11688 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga5P11688 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga5P11688 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itga5P11688 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itga5P11688 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga5P11688 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itga5P11688 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga5P11688 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga5P11688 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga5P11688 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga5P11688 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itga5P11688 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Itga5P11688 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga5P11688 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itga5P11688 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga5P11688 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga5P11688 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga5P11688 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga5P11688 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itga5P11688 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Itga5P11688 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga5P11688 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itga5P11688 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga5P11688 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga5P11688 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itga5P11688 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itga5P11688 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itga5P11688 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga5P11688 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga5P11688 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Itga5P11688 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Itga5P11688 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itga5P11688 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga5P11688 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itga5P11688 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga5P11688 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itga5P11688 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga5P11688 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga5P11688 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itga5P11688 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga5P11688 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga5P11688 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga5P11688 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itga5P11688 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Itga5P11688 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Itga5P11688 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga5P11688 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga5P11688 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itga5P11688 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga5P11688 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga5P11688 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga5P11688 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga5P11688 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga5P11688 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itga5P11688 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Itga5P11688 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itga5P11688 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga5P11688 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga5P11688 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itga5P11688 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga5P11688 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga5P11688 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga5P11688 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itga5P11688 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itga5P11688 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga5P11688 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga5P11688 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga5P11688 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga5P11688 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga5P11688 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga5P11688 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga5P11688 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga5P11688 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga5P11688 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga5P11688 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga5P11688 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga5P11688 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itga5P11688 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga5P11688 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga5P11688 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms