Protein–RNA interactions for Protein: P10287

Cdh3, Cadherin-3, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh3P10287 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh3P10287 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh3P10287 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh3P10287 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh3P10287 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh3P10287 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh3P10287 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh3P10287 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh3P10287 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh3P10287 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh3P10287 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh3P10287 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh3P10287 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh3P10287 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh3P10287 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh3P10287 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh3P10287 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh3P10287 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh3P10287 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh3P10287 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh3P10287 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh3P10287 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh3P10287 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh3P10287 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh3P10287 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh3P10287 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh3P10287 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh3P10287 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh3P10287 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdh3P10287 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh3P10287 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh3P10287 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh3P10287 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh3P10287 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh3P10287 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh3P10287 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh3P10287 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh3P10287 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh3P10287 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh3P10287 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh3P10287 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh3P10287 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh3P10287 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh3P10287 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh3P10287 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh3P10287 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh3P10287 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh3P10287 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh3P10287 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh3P10287 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh3P10287 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh3P10287 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh3P10287 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh3P10287 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh3P10287 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh3P10287 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh3P10287 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh3P10287 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh3P10287 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh3P10287 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh3P10287 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh3P10287 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh3P10287 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdh3P10287 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdh3P10287 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdh3P10287 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdh3P10287 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cdh3P10287 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh3P10287 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh3P10287 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh3P10287 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh3P10287 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdh3P10287 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh3P10287 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh3P10287 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdh3P10287 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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