Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itgb1P09055 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itgb1P09055 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itgb1P09055 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itgb1P09055 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itgb1P09055 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itgb1P09055 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itgb1P09055 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Itgb1P09055 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itgb1P09055 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itgb1P09055 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itgb1P09055 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itgb1P09055 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itgb1P09055 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Itgb1P09055 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itgb1P09055 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itgb1P09055 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itgb1P09055 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itgb1P09055 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itgb1P09055 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itgb1P09055 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itgb1P09055 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itgb1P09055 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Itgb1P09055 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itgb1P09055 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itgb1P09055 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itgb1P09055 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itgb1P09055 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itgb1P09055 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itgb1P09055 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb1P09055 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Itgb1P09055 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itgb1P09055 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itgb1P09055 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itgb1P09055 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itgb1P09055 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itgb1P09055 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itgb1P09055 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itgb1P09055 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itgb1P09055 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itgb1P09055 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itgb1P09055 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itgb1P09055 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itgb1P09055 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itgb1P09055 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itgb1P09055 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itgb1P09055 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itgb1P09055 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itgb1P09055 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Itgb1P09055 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Itgb1P09055 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itgb1P09055 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Itgb1P09055 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Itgb1P09055 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Itgb1P09055 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Itgb1P09055 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itgb1P09055 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itgb1P09055 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itgb1P09055 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itgb1P09055 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itgb1P09055 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itgb1P09055 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itgb1P09055 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itgb1P09055 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itgb1P09055 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Itgb1P09055 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itgb1P09055 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itgb1P09055 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Itgb1P09055 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itgb1P09055 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itgb1P09055 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itgb1P09055 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Itgb1P09055 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Itgb1P09055 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itgb1P09055 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itgb1P09055 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itgb1P09055 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itgb1P09055 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itgb1P09055 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itgb1P09055 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itgb1P09055 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itgb1P09055 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itgb1P09055 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Itgb1P09055 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Itgb1P09055 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itgb1P09055 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itgb1P09055 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itgb1P09055 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itgb1P09055 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itgb1P09055 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itgb1P09055 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itgb1P09055 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itgb1P09055 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Itgb1P09055 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Itgb1P09055 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Itgb1P09055 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Itgb1P09055 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb1P09055 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itgb1P09055 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Itgb1P09055 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms