Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxb3P09026 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxb3P09026 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxb3P09026 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxb3P09026 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Hoxb3P09026 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxb3P09026 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxb3P09026 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hoxb3P09026 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxb3P09026 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxb3P09026 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxb3P09026 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxb3P09026 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxb3P09026 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxb3P09026 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxb3P09026 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxb3P09026 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxb3P09026 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxb3P09026 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxb3P09026 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxb3P09026 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hoxb3P09026 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxb3P09026 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxb3P09026 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxb3P09026 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb3P09026 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb3P09026 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxb3P09026 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxb3P09026 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hoxb3P09026 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxb3P09026 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxb3P09026 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxb3P09026 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxb3P09026 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hoxb3P09026 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxb3P09026 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxb3P09026 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxb3P09026 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxb3P09026 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxb3P09026 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxb3P09026 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxb3P09026 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxb3P09026 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxb3P09026 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxb3P09026 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxb3P09026 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxb3P09026 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxb3P09026 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxb3P09026 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxb3P09026 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb3P09026 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxb3P09026 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxb3P09026 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb3P09026 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxb3P09026 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb3P09026 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb3P09026 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb3P09026 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb3P09026 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxb3P09026 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb3P09026 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb3P09026 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb3P09026 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb3P09026 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxb3P09026 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb3P09026 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb3P09026 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb3P09026 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxb3P09026 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxb3P09026 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxb3P09026 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxb3P09026 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxb3P09026 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb3P09026 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxb3P09026 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxb3P09026 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxb3P09026 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxb3P09026 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxb3P09026 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxb3P09026 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms