Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P06330 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P06330 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06330 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06330 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06330 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06330 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06330 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06330 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06330 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06330 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06330 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P06330 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P06330 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P06330 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P06330 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P06330 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P06330 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P06330 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
P06330 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P06330 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06330 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06330 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06330 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06330 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P06330 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P06330 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P06330 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P06330 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P06330 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06330 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06330 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06330 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06330 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06330 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P06330 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P06330 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P06330 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P06330 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P06330 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P06330 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P06330 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P06330 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06330 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06330 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06330 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06330 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06330 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06330 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06330 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06330 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06330 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06330 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06330 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06330 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P06330 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P06330 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06330 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06330 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06330 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06330 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P06330 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06330 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P06330 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P06330 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P06330 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P06330 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P06330 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P06330 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P06330 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P06330 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P06330 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P06330 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P06330 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P06330 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06330 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06330 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06330 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06330 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06330 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06330 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06330 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06330 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P06330 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06330 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06330 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06330 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P06330 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06330 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06330 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06330 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06330 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06330 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06330 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06330 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06330 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06330 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06330 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06330 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06330 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms