Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P01672 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P01672 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P01672 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
P01672 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
P01672 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
P01672 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P01672 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
P01672 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
P01672 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
P01672 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
P01672 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
P01672 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01672 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01672 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01672 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01672 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P01672 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
P01672 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
P01672 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
P01672 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
P01672 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P01672 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
P01672 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P01672 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P01672 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P01672 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P01672 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P01672 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
P01672 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01672 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01672 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P01672 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
P01672 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P01672 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
P01672 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P01672 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P01672 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P01672 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
P01672 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P01672 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
P01672 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01672 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01672 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01672 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
P01672 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01672 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01672 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01672 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01672 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01672 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01672 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01672 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P01672 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P01672 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01672 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01672 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01672 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01672 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01672 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01672 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
P01672 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01672 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
P01672 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P01672 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01672 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01672 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01672 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P01672 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P01672 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01672 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
P01672 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P01672 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01672 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01672 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01672 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01672 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01672 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01672 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01672 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01672 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01672 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01672 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
P01672 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01672 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01672 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01672 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01672 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01672 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01672 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01672 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01672 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01672 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01672 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01672 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01672 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01672 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01672 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01672 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01672 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms