Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shoc2O88520 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Shoc2O88520 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Shoc2O88520 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shoc2O88520 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shoc2O88520 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shoc2O88520 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Shoc2O88520 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Shoc2O88520 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shoc2O88520 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shoc2O88520 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shoc2O88520 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Shoc2O88520 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shoc2O88520 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Shoc2O88520 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Shoc2O88520 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shoc2O88520 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Shoc2O88520 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shoc2O88520 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Shoc2O88520 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shoc2O88520 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Shoc2O88520 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shoc2O88520 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shoc2O88520 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Shoc2O88520 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shoc2O88520 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shoc2O88520 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shoc2O88520 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shoc2O88520 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shoc2O88520 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Shoc2O88520 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shoc2O88520 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Shoc2O88520 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Shoc2O88520 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shoc2O88520 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Shoc2O88520 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shoc2O88520 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Shoc2O88520 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Shoc2O88520 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Shoc2O88520 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Shoc2O88520 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Shoc2O88520 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Shoc2O88520 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Shoc2O88520 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Shoc2O88520 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Shoc2O88520 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Shoc2O88520 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Shoc2O88520 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shoc2O88520 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shoc2O88520 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Shoc2O88520 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shoc2O88520 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shoc2O88520 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Shoc2O88520 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shoc2O88520 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shoc2O88520 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Shoc2O88520 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shoc2O88520 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shoc2O88520 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Shoc2O88520 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shoc2O88520 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shoc2O88520 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shoc2O88520 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shoc2O88520 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Shoc2O88520 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Shoc2O88520 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shoc2O88520 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shoc2O88520 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shoc2O88520 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shoc2O88520 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Shoc2O88520 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Shoc2O88520 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Shoc2O88520 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Shoc2O88520 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shoc2O88520 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shoc2O88520 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shoc2O88520 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Shoc2O88520 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shoc2O88520 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Shoc2O88520 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms