Protein–RNA interactions for Protein: O88319

Ntsr1, Neurotensin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntsr1O88319 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ntsr1O88319 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ntsr1O88319 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ntsr1O88319 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ntsr1O88319 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ntsr1O88319 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ntsr1O88319 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ntsr1O88319 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ntsr1O88319 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ntsr1O88319 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ntsr1O88319 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ntsr1O88319 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ntsr1O88319 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ntsr1O88319 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ntsr1O88319 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ntsr1O88319 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ntsr1O88319 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ntsr1O88319 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ntsr1O88319 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ntsr1O88319 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ntsr1O88319 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ntsr1O88319 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ntsr1O88319 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ntsr1O88319 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ntsr1O88319 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ntsr1O88319 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ntsr1O88319 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ntsr1O88319 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ntsr1O88319 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ntsr1O88319 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ntsr1O88319 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ntsr1O88319 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ntsr1O88319 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ntsr1O88319 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ntsr1O88319 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ntsr1O88319 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ntsr1O88319 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ntsr1O88319 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ntsr1O88319 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ntsr1O88319 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ntsr1O88319 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ntsr1O88319 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ntsr1O88319 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ntsr1O88319 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ntsr1O88319 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ntsr1O88319 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ntsr1O88319 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ntsr1O88319 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms