Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrna4O70174 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrna4O70174 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrna4O70174 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrna4O70174 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrna4O70174 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrna4O70174 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chrna4O70174 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Chrna4O70174 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chrna4O70174 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chrna4O70174 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chrna4O70174 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chrna4O70174 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrna4O70174 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna4O70174 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna4O70174 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna4O70174 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna4O70174 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna4O70174 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna4O70174 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna4O70174 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrna4O70174 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrna4O70174 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrna4O70174 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chrna4O70174 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna4O70174 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna4O70174 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna4O70174 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna4O70174 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna4O70174 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna4O70174 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna4O70174 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna4O70174 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna4O70174 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chrna4O70174 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chrna4O70174 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna4O70174 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna4O70174 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna4O70174 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna4O70174 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna4O70174 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna4O70174 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Chrna4O70174 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Chrna4O70174 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna4O70174 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chrna4O70174 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrna4O70174 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Chrna4O70174 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chrna4O70174 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna4O70174 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chrna4O70174 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chrna4O70174 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chrna4O70174 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrna4O70174 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrna4O70174 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrna4O70174 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrna4O70174 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chrna4O70174 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chrna4O70174 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chrna4O70174 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chrna4O70174 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chrna4O70174 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chrna4O70174 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chrna4O70174 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chrna4O70174 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrna4O70174 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrna4O70174 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chrna4O70174 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chrna4O70174 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chrna4O70174 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chrna4O70174 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chrna4O70174 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chrna4O70174 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chrna4O70174 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chrna4O70174 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chrna4O70174 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrna4O70174 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrna4O70174 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrna4O70174 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chrna4O70174 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrna4O70174 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrna4O70174 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrna4O70174 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chrna4O70174 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chrna4O70174 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chrna4O70174 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chrna4O70174 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chrna4O70174 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Chrna4O70174 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna4O70174 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna4O70174 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Chrna4O70174 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna4O70174 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Chrna4O70174 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna4O70174 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna4O70174 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna4O70174 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Chrna4O70174 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna4O70174 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Chrna4O70174 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms